Lielākajā daļā zinātnisko eksperimentu ir grūti vai neiespējami pierādīt, ka kaut kas ir patiess. Tā vietā daudzi zinātnieki izvirza hipotēzes par to, kas, viņuprāt, notiks. Hipotēzes var būt divas vai vairākas iespējas, kas ir pretrunīgas, tikai viena var būt patiesa, un izsmeļoša, tās aptver visus iespējamos rezultātus. Hipotēzi, kas tiek uzskatīta par patiesu, sauc par nulles hipotēzi, bet pārējās hipotēzes sauc par alternatīvajām hipotēzēm.
Ar hipotēzi zinātnieks mēģina izskaidrot notikumu vai novērojumu, pamatojoties uz pašreizējo informāciju. Izmantojot hipotēzi, var izdarīt prognozes un pēc tam pārbaudīt. Laba hipotēze ir tāda, kas izskaidro visus novērojuma aspektus, ir vienkāršākais iespējamais skaidrojums, ko var izteikt tā, lai par to varētu izdarīt prognozes, un, visbeidzot, tā ir pārbaudāma ar eksperimentu palīdzību.
Fakts, ka šī hipotēze tiek uzskatīta par patiesu, pat īslaicīgi, ir tas, kas tiek pārbaudīts eksperimentos. Bieži vien tiek teikts, ka zinātnisko eksperimentu dēļ izmaiņas vai ietekme nebūs. Eksperimenta laikā zinātnieks mēģina vai nu noraidīt, vai nespēj noraidīt šo hipotēzi. To noraidot, tad izriet, ka viena no alternatīvajām hipotēzēm ir pareiza vai pareizāka par nulles hipotēzi.
Zinātnē kaut ko pierādīt vai pieņemt ir gandrīz neiespējami. Tā vietā hipotēzes tiek noraidītas vai noraidītas. Piemēram, nulles hipotēze var būt tāda, ka konkrētas zāles neietekmēs tos cilvēkus, kuriem tās tiek ievadītas. Ja efekts tiek novērots narkotiku grupā, nulles hipotēze tiek noraidīta par labu alternatīvai hipotēzei. Ja šķiet, ka narkotiku grupā nav nekādas ietekmes, tad to nav izdevies noraidīt un parasti ir nepieciešami papildu testi.
Statistikā nulles hipotēze tiek uzskatīta par hipotēzi, kurai nav būtiskas statistiskas atšķirības. Citiem vārdiem sakot, tas ir statistiskās vienlīdzības paziņojums. Tam nav precīzi jāatbilst vērtībai, bet hipotēzei un novērotajam paraugam ir jābūt līdzīgam, nevis atšķirīgam, pietiekami, lai hipotēzi noraidītu. Ja nulles hipotēze tiek noraidīta, tas nozīmē, ka tā statistiski būtiski atšķiras no novērotās grupas, un šī atšķirība nav saistīta ar nejaušību.
Ja nulles hipotēze netiek noraidīta, tā tiek uzskatīta par statistiski līdzīgu. Šī līdzība bieži tiek attiecināta uz nejaušu izlases kļūdu, kas nozīmē, ka atšķirības lielums ir nejaušības dēļ. Ja tas tiek noraidīts, tā nav eksperimentētāja neveiksme. Patiesībā lielākajai daļai pētnieku un zinātnieku ir maz vai vispār nav cerību, ka hipotēze būs patiesa. Noraidīta nulles hipotēze ir nozīmīgs zinātnisko eksperimentu rezultāts.