Organiskā zobu pasta atšķiras no parastās zobu pastas, jo sastāv no dabīgiem augiem un eļļām. Turpretim parastā zobu pasta satur neorganiskas ķīmiskas vielas un citas sastāvdaļas. Tāpat kā parastā zobu pasta, arī organiskā zobu pasta ir želeja vai pasta, atskaitot skarbās ķīmiskās vielas. Pēdējos gados tas ir kļuvis populārs, jo arvien vairāk cilvēku meklē produktus, kas ir videi nekaitīgi, kā arī veselībai nekaitīgi.
Dabiskās eļļas un augi dominē kā galvenās organiskās zobu pastas sastāvdaļas. Parastās dabiskās eļļas ir piparmētru un eikalipta eļļa. Dažas citas dabiskās eļļas, kas atrodamas organiskajā zobu pastā, ir kanēlis un citrons. Glicerīns, kura pamatā ir dārzeņi, palīdz organiskajai zobu pastai kā mitrinātājs, un ksilīts kalpo kā dabisks saldinātājs, ko iegūst no kukurūzas, ogām, bērziem un citiem augiem, augļiem un dārzeņiem. Ksilīts darbojas arī kā alternatīva fluoram kā dobumu un aplikuma cīnītājs.
Organiskajai zobu pastai piemīt antiseptiskas īpašības, kas dabiski attīra zobus, kā arī likvidē zobakmeni un aplikumu, nenolietojot emalju. Daži produkti arī apgalvo, ka tie nomierina zobu jutīgumu un dziedē problēmas, kas saistītas ar rūsas čūlām un gingivītu. Piparmētru un citu ēterisko eļļu dabīgie aromatizētāji arī nodrošina ilgāku svaigu elpu, salīdzinot ar neorganiskām zobu pastām, kurām ir īslaicīga iedarbība. Eļļas, kas atrodamas zobu pastā, kas ir organiskas, ir pat saistītas ar sāpju ārstēšanu, stresa mazināšanu, ādas mitrināšanu un garastāvokļa paaugstināšanu.
Lai gan organiskajai zobu pastai un parastajai zobu pastai ir viens un tas pats mērķis – veicināt svaigu elpu, tīrīt un balināt zobus un novērst gingivītu, daudzi patērētāji dod priekšroku organiskai zobu pastai, jo tajā ir dabīgas augu izcelsmes sastāvdaļas. Parastajā zobu pastā atrodamās aktīvās sastāvdaļas ir sintētiskās ķīmiskās vielas nātrija laurilsulfāts, fluorīds un ūdeņraža peroksīds. Šīs aktīvās sastāvdaļas ir identificētas kā toksīni, kas var radīt problēmas, sākot no nelieliem traucējumiem līdz lielām veselības problēmām. Sintētiskās ķīmiskās vielas zobu pastā var nolietot zobu emalju un izžūt mutes gļotādu, izraisot sliktu elpu un rūsas čūlas. Fluorīdu saturošas zobu pastas lietošanas vai uzņemšanas ilgtermiņa sekas ir saistītas ar smadzeņu, kaulu un nieru veselības apdraudējumu, īpaši bērniem.
Nātrija laurilsulfāts ir otra neorganiskā sastāvdaļa, kas izveidota, lai parastajai zobu pastai pievienotu putas. Tā ir tā pati sastāvdaļa, kas atrodama mazgāšanas līdzekļos, ziepēs, matu kopšanas un tīrīšanas līdzekļos. Organiskā zobu pasta parasti piesaista patērētājus, kuri cenšas izmantot populārākajos zobu pastas zīmolos atrodamās sastāvdaļas.
Bioloģiskais marķējums attiecas uz zobu pastu tikai tad, ja tā ir 100% brīva no fluora, nātrija laurilsulfāta, ūdeņraža peroksīda, sintētiskām garšvielām un pārtikas krāsvielām. Arī bioloģiskajā zobu pastā vajadzētu iztrūkt naftas un parabēnu, jo tās ir sintētiskas ķīmiskas vielas, ko izmanto eļļā vai kā kosmētikas konservantus. Patērētāji var iegādāties bioloģisko zobu pastu lielākajā daļā dabisko pārtikas preču veikalu un tiešsaistē, vai arī viņi var pagatavot paši, kā galveno sastāvdaļu izmantojot cepamo sodu.