Antigēna un antivielu saistīšanās notiek, kad antiviela tiek piesaistīta antigēnam un pievienojas tam. Kamēr antiviela ir pievienota, tā rada ķīmisku reakciju, kas galu galā novedīs pie antigēna iznīcināšanas. Tikai specifiskas antivielas var saistīties ar dažāda veida antigēniem, lai gan antigēnus, kuriem ir līdzīga struktūra, var uzbrukt vienas un tās pašas antivielas. Saite starp antigēnu un antivielu ir atgriezeniska, tāpēc antivielai ir jāmēģina izveidot vairākus savienojumus ar antigēnu, lai saglabātu savienojumu, līdz tā izvada antigēnu.
Ir daudz dažādu antigēnu veidu, lai gan lielākā daļa ir olbaltumvielu antigēni, kas var piesaistīt antivielas. Daudzi antigēni, piemēram, vīrusi un baktērijas, ir kaitīgi, savukārt citi, piemēram, ziedputekšņi vai citi alergēni, paši par sevi ir nekaitīgi. Antivielas, kas iesaistītas antigēnu un antivielu saistīšanā, ir pazīstamas kā imūnglobulīni. Tās ir molekulas, kuras ražo organisma imūnsistēma, lai iznīcinātu svešķermeņus.
Imūnglobulīniem var būt augsta vai zema afinitāte pret noteiktiem antigēniem. Ja afinitātes līmenis ir augsts, antigēna un antivielu saistīšanās ir spēcīga. Šī spēcīgā saikne starp imūnglobulīnu un antigēnu ļauj imūnglobulīnam uzsākt ķīmisku reakciju kaskādi, kas galu galā sadala un iznīcina antigēnu.
Pat ja antivielas afinitāte pret antigēnu ir ārkārtīgi augsta, saistīšanās ar antigēnu un antivielu nav pastāvīga. Antigēnam ir iespējams pārtraukt savienojumu ar antivielu, lai aizsargātu pret tā uzbrukumu. Lai to novērstu, antivielai jāmēģina saistīties ar antigēnu, izmantojot vairākus dažādus savienojumus.
Antigēna un antivielu saistīšanās parasti ir atkarīga no vāju elektrisko lādiņu izmantošanas, lai savilktu kopā antigēnu un antivielu. Elektronu afinitāte vienā saites pusē un neliels negatīvs lādiņš otrā pusē ir visizplatītākais šo divu veidu molekulu saistīšanās iemesls. Saišu veidi, kas satur molekulas kopā, var būt hidrofobās, elektrostatiskās vai ūdeņraža saites vai Van der Vālsa spēki.
Visa antigēna un antivielu saistīšanās nav kovalenta, kas nozīmē, ka tām nav kopīgu elektronu. Tās paliek diskrētas molekulas pat tad, kad tās ir saistītas. Tas nozīmē, ka tad, kad tie sadalās, katrs ir neskarts.