Salīdzināšanas mikroskops sastāv no diviem atsevišķiem kopā savienotiem mikroskopiem un tiek izmantots divu objektu vai paraugu salīdzināšanai. Ierīces veids, ko sauc par optisko tiltu, ļauj lietotājam skatīt abus paraugus vienlaikus. Šāda veida mikroskops ir nozīmīgs tiesībaizsardzībā — kriminālistikas un ballistikas analīzes jomās. Tas ļauj savstarpēji salīdzināt lodes un ložu fragmentus, kā arī citus kriminālistikas pierādījumus, ko var izmantot, lai pierādītu vainu vai attaisnotu aizdomās turamo dažos noziegumos.
Mikroskops ir viens no svarīgākajiem izgudrojumiem cilvēces vēsturē. Tas ir ļāvis attīstīties daudzām zinātnēm un radikāli mainījis daudzas mūsu idejas par gandrīz katru fizisko zinātni un pat veicinājis jaunu zinātņu radīšanu. Ideja apvienot divus mikroskopus, lai vienlaikus varētu pētīt divus paraugus, bija tikai jau labi izstrādāto tehnoloģiju paplašinājums, ko izmanto standarta mikroskopu izgatavošanai. Agrīnās salīdzināšanas mikroskopa optiskais tilts nebija nekas vairāk kā divi spoguļu pāri, viens katram mikroskopam, kas novirzīja atsevišķos attēlus vienā skatītājā, radot abu paraugu skatu vienā attēlā.
Šī jaunā tipa mikroskopa izgudrošanas rezultātā tika attīstītas daudzas zinātnes disciplīnas, jo īpaši ballistika un kriminālistika. Iespēja pārbaudīt un salīdzināt divus paraugus blakus ļāva pozitīvi noteikt, vai divas lodes ir izšautas no viena ieroča vai no dažādiem ieročiem. Izmantojot izmēģinājuma lodi kā vadību, tas arī ļāva noteikt, vai konkrētā lode tika izšauta no noteikta ieroča vai nē.
Tā izgudrojumam sekoja daudzi citi salīdzināšanas mikroskopa lietojumi kriminālistikā. Gandrīz jebkura materiāla paraugus var salīdzināt, lai noteiktu pārsūtīšanas vai izsekošanas pierādījumus. Šādā veidā var salīdzināt arī matu paraugus un pirkstu nospiedumus. Var salīdzināt arī rokraksta paraugus un bioloģiskos paraugus, piemēram, baktērijas un aļģes. Rīku zīmes var salīdzināt, lai noteiktu, kuri rīki tika izmantoti objektam, vai saskaņotu atsauces rīku ar kādu, par kuru zināms, ka tas ir izmantots noziegumā.
Mūsdienu tehnoloģijas ir veikušas daudzus uzlabojumus pamata salīdzināšanas mikroskopā. Datori un optiskās šķiedras ļauj attēlot attēlus uz monitoriem vai projekcijas ekrāniem un novietot vienu virs otra. Salīdzināšanas mikroskopā var būt pieejamas daudzas iespējas, piemēram, apgaismojums, palielinājuma pakāpes un iespēja fotografēt paraugu salīdzināšanu.