Aftozas čūlas ārstēšana var ietvert mutes skalošanu un iekšķīgi lietojamas vai lokālas zāles. Var palīdzēt arī daži mājas aizsardzības līdzekļi, piemēram, magnēzija piena lietošana un pacienta diētas maiņa. Dažos gadījumos tā ir pamatslimības, piemēram, pārtikas jutīguma vai alerģiju, pazīme, un tādā gadījumā ir jānovērš arī cēlonis. Vieglas aftozas čūlas var nebūt nepieciešama ārstēšana, jo tās parasti izzūd pašas pēc nedēļas vai divām.
Pacients ar aftozu čūlu, ko biežāk sauc par rūsu, dažreiz var sajaukt šo stāvokli ar aukstumpumpu. Aukstumpumpas rodas uz lūpām, savukārt aftozas čūlas attīstās mutes dobumā un var kļūt sāpīgas, apgrūtinot runu un ēšanu. Satraucošas aftozas čūlas var būt pārklātas ar biezu pastu, kas izgatavota no cepamās sodas un ūdens. Pacients var arī izmēģināt mājās gatavotu mutes skalošanu, kas sastāv no sāls un ūdens vai cepamās sodas un ūdens.
Ledus skaidas var izmantot arī aftozas čūlas ārstēšanai. Pacientam vairākas reizes dienā jāuztur ledus virs čūlas, lai mazinātu sāpes. Lokāla magnēzija piena piliena lietošana dažas reizes dienā var paātrināt dzīšanu. Izvairīšanās no pikanta vai abrazīva ēdiena var papildināt arī aftozās čūlas ārstēšanu. Rūpīga mutes dobuma higiēna var palīdzēt novērst aftozās čūlas bakteriālas infekcijas attīstību.
Ja čūla nedzīst nedēļas vai divu laikā vai ir smaga, pacientiem jādodas pie ārsta, lai ārstētu aftozu čūlu. Recepšu stipruma mutes skalojamais līdzeklis var atvieglot iekaisumu un mazināt diskomfortu. Viņš var arī izrakstīt pastu, kas satur fluocinonīdu, amleksanoksu vai benzokaīnu, lai palīdzētu paātrināt dzīšanas procesu. Šīs pastas lokāli jāuzklāj uz rūsa. Vēl viena aktuāla aftozas čūlas ārstēšana ir debakterols, ķīmisks šķīdums.
Ārsts var arī ieteikt perorālus medikamentus aftozas čūlas ārstēšanai, kas var ietvert zāles pret grēmas. Retāk kortikosteroīdus var lietot, ja čūla nereaģē uz citām ārstēšanas metodēm. Pacienti, kuri patērē nepietiekamu uzturu, var gūt labumu no uztura bagātinātājiem, piemēram, B vitamīniem un dzelzs.
Aftozas čūlas dažkārt var liecināt par nopietnāku pamatslimību. Pacientiem jāinformē ārsti par visiem citiem viņu veselības stāvokļiem. Tā var būt reakcija uz pārtikas alerģijām vai jutīgumu. Pacientiem no uztura jāizslēdz kaitīgie pārtikas produkti, lai papildinātu aftozās čūlas ārstēšanu. Šīs čūlas var arī liecināt par pavājinātu imūnsistēmu, celiakiju vai iekaisīgām zarnu slimībām, kuru ārstēšanai ārsts, iespējams, izrakstīs citas ārstēšanas metodes.