Bērnu imūnsistēma ir gan sarežģīta, gan ievērojama. Parasti vesels zīdainis piedzimst ar dažām antivielām, ko piegādā māte. To sauc par mātes imunitāti, taču tā tiek uzskatīta par īslaicīgu, pasīvu imunitāti, un tā nav garantija pret visu veidu infekcijām. Lai bērnu imūnsistēma attīstītos normāli, ir nepieciešama zināma svešu antigēnu iedarbība, un regulārs vakcināciju grafiks palīdz nodrošināt tās antivielas, kuras nevar iegūt pasīvi.
Bērnu imūnsistēmas pamatā ir savstarpēji atkarīgas šūnas un orgāni, kas aizsargā organismu no infekcijām. Mandeles, adenoīdi, limfmezgli, kaulu smadzenes, baltās asins šūnas un pat zarnu trakts ir visas ķermeņa daļas, kas palīdz aizsargāt bērnu organismu no dažāda veida infekcijām. Normālam zīdainim var sākties imūnās atbildes reakcija pret svešiem antigēniem, sākot ar piedzimšanu, ja visas šūnas un orgāni darbojas pareizi.
Antivielas tiek izstrādātas laika gaitā, jo organisms kļūst spējīgāks sintezēt antivielas, reaģējot uz antigēniem. Mātes iegūtā imunitāte sāk izzust sešu līdz astoņu mēnešu vecumā, un ir nepieciešami apmēram seši līdz astoņi gadi, līdz bērnu imūnsistēma iegūst koncentrētu antivielu līmeni. Daļēji šis laika grafiks izskaidro, kāpēc daudzi bērni agrīnā stadijā piedzīvo vairāk slimību, piemēram, saaukstēšanās, bet arvien mazāk, tuvojoties pusaudža vecumam.
Attīstošās imūnsistēmas būtība ir tāda, ka tā kļūst stiprāka, kad tā pati spēj cīnīties ar infekciju. Un otrādi, infekcijas, ar kurām organisms nespēj cīnīties un kuras bez izšķirības tiek ārstētas ar antibiotikām, tikai vājina imūnsistēmu. Antibiotikas ir ārkārtīgi noderīgas zāles, ja tās lieto tādu infekciju ārstēšanai, ar kurām organisms pats nevar cīnīties, taču no pārmērīgas lietošanas jāizvairās.
Bērnam augot, viņa imūnsistēmas sastāvdaļas nedaudz mainās. Piemēram, adenoīdi un mandeles, sākoties pubertātei, bieži samazinās līdz mazākam izmēram. Tas ir tāpēc, ka bērnu imūnsistēma, attīstoties, ir mazāk atkarīga no viņiem. Dažos gadījumos šiem orgāniem var būt hroniskas infekcijas vai patoloģiska palielināšanās pazīmes, un tie bieži tiek izņemti, lai izvairītos no citu ķermeņa funkciju traucējumiem.
Bērni ar patoloģisku imūnsistēmu nespēj cīnīties ar infekciju tā, kā to spēj vesels bērns. Vecākiem vajadzētu pievērst īpašu uzmanību pastāvīgas infekcijas pazīmēm, tostarp hroniskiem un augsta līmeņa drudzis, nakts svīšana un jutīgi vai pietūkuši limfmezgli. Regulāri jānovērtē bērnu fiziskā un emocionālā attīstība, veselības aprūpes process, kas uzrauga arī imūnsistēmas attīstību.
Lai palīdzētu bērniem normāli attīstīties imūnsistēmai, grūtniecēm vajadzētu izvairīties no alkohola un tabakas, ēst veselīgu pārtiku un lietot pirmsdzemdību vitamīnus. Pasīvās smēķēšanas iedarbība zīdaiņa vecumā un bērnībā arī nomāc bērnu imūnsistēmu. Citi apstākļi, piemēram, vitamīnu trūkums, asins slimības un vēzis, ietekmēs imunitāti.