Ir divas galvenās divpusējo (divpusēji simetrisku) dzīvnieku grupas: protostomi un deuterostomi. Tos sauc arī par superfilu, jo katrs satur vairākus dzīvnieku filus. Deuterostomas mēdz būt sarežģītākas un ietver adatādaiņus, hemihordātus, hordātus (visus mugurkaulniekus) un dažas mazākas filas. Protostostos ir praktiski viss pārējais, ieskaitot posmkājus, anelīdus, plakanos tārpus, mīkstmiešus utt. Dažas nelielas filas nav klasificētas kā viena, ne otra. Galvenā atšķirība starp abām grupām ir tā, kā tās attīstās kā embriji: protostomās pirmā atvere embrijā kļūst par muti, bet deuterostomās tā kļūst par tūpļa atveri.
Lielākā daļa zinātnieku protostos atpazīst vismaz trīs superfilas – Lophotrochozoa, Edcysozoa un Platyzoa. Šīs superfilas tika ierosinātas attiecīgi 1995., 1997. un 1998. gadā, pamatojoties uz molekulāriem un morfoloģiskiem pierādījumiem. Lophotrochozoans (“dzīvnieki, kas nes cekulus”) vieno lofofors, kas ap muti ir ciliāru taustekļu gredzens, ko izmanto, lai satvertu barības daļiņas. Lophotrochozoans, ko dažreiz sauc arī par trochozoans, ietver apmēram duci dzimtas: Entoprocta, Mollusca, Annelida, Phoronida, Brachiopoda, Nemertea, Chaetognatha, Bryozoa, Myzostomida, Acoela un Gnathostomulida. Lielākā daļa lofotrochozoju ir jūras, un tas ir loģiski, jo zemūdens ir visnoderīgākie skropstainie mutes taustekļi barības satveršanai.
Bez lophotrochozoans, vēl viena pārsvarā jūras protostomu superfila ir platizoans (“plakanie dzīvnieki”), kas ietver plakanos tārpus un vairākus svarīgus mikroskopiskus planktona dzīvniekus, piemēram, rotiferus un gastrotrichs. Platyzoans izceļas ar to, ka tiem nav cēloma (ķermeņa dobuma), vai arī ar samazinātu celomu, ko sauc par pseidokoelu. Vidēji pīļknābis ir vienkāršākais no protostomas superfila, lai gan vienkārši organismi ir sastopami arī starp lofotrochozoaniem. Platyzoans agrāk tika uzskatīti par Lophotrochozoa locekļiem, taču lielākā daļa zinātnieku tagad viņiem piešķir savu grupu.
Pēdējās protostomas superfilas ir ekdisozoa, kas izceļas ar to eksoskeletu izkausēšanu (ekdīze). Ecdisozoa ir visveiksmīgākā un izplatītākā no protostomu superfila, un tajā ietilpst posmkāji (vēžveidīgie, kukaiņi, helicerāti un miriapodi), nematodes (apaļtārpi), tardigrades, samta tārpi un vairākas mazākas filas. Nematodes ir viens no daudzskaitlīgākajiem dzīvniekiem uz Zemes, kas sastopams jebkurā iespējamā vidē, tostarp Antarktīdā, savukārt posmkājos ir visvairāk sugu, iespējams, vairāk nekā 7 miljoni, kas veido vairāk nekā 90% no visas dzīvnieku bioloģiskās daudzveidības uz Zemes. Lai gan ir daudzi citi organismi, kas izmanto kādu čaumalu vai ārējo kutikulu, ekdisozoa, protams, ir visefektīvākā evolūcijas ziņā.