Minociklīns un doksiciklīns ir plaša spektra, ilgstošas darbības, daļēji sintētiskas antibiotikas tetraciklīnu saimē. Abi ir bakteriostatiski, jo tie neļauj baktērijām vairoties, traucējot olbaltumvielu sintēzi. Tos lieto līdzīgu stāvokļu, tostarp baktēriju un vienšūņu infekciju, ārstēšanai. Tomēr starp šīm divām zālēm ir daudz atšķirību. Viņiem ir dažas dažādas specialitātes, darbības spektri, blakusparādības un drošības jautājumi.
Doksiciklīnu lieto arī kā antihelmintisku vai prettārpu līdzekli papildus bakteriālu un vienšūņu infekciju ārstēšanai. Tas ir bioaktīvāks medikaments nekā citas tetraciklīna antibiotikas, tostarp minociklīns. Un otrādi, minociklīns ir plašāka darbības spektra zāles nekā doksiciklīns, un to lieto pret plašāku baktēriju klāstu. Minociklīnu lieto arī reimatoīdā artrīta ārstēšanai, un šajā amatā to iesaka Amerikas Reimatoloģijas koledža.
Citas atšķirības starp minociklīnu un doksiciklīnu ietver to šķīdību un citas ķīmiskās īpašības. Minociklīns labāk šķīst taukos, bet doksiciklīns vieglāk šķīst ūdenī. Šī iemesla dēļ minociklīns vieglāk šķērso hematoencefālisko barjeru nekā doksiciklīns un izraisa vairāk centrālās nervu sistēmas (CNS) blakusparādību. Doksiciklīns, jo tas labāk šķīst ūdenī, ir labāka izvēle urīnceļu infekcijām, jo tā aktīvie metabolīti tiek izšķīdināti un izvadīti ar urīnu. Šīs zāles nedrīkst lietot kopā ar kalcija piedevām vai ar kalciju bagātu pārtiku, kas bloķē uzsūkšanos, savukārt minociklīna gadījumā šādu ierobežojumu nav.
Dažas blakusparādības arī atšķiras starp šīm zālēm. Minociklīna lielāka šķīdība lipīdos izraisa biežākas centrālās nervu sistēmas blakusparādības, piemēram, reiboni un letarģiju. Zināma, bet reta šo zāļu blakusparādība ir sekundāra intrakraniāla hipertensija, nopietns stāvoklis, par kuru vispirms liecina galvassāpes, dezorientācija un reibonis. Tas ir saistīts arī ar sistēmiskas vilkēdes un vairogdziedzera vēža attīstību vai saasināšanos. Saikne starp šiem diviem stāvokļiem un minociklīnu nav noteikta kā cēlonis, taču eksperti brīdina, ka šo zāļu lietošanas laikā ir rūpīgi jānovērtē.
Tāpat kā visas tetraciklīna grupas antibiotikas, minociklīns un doksiciklīns var izraisīt paaugstinātu fotosensitivitāti vai saules apdegumus ar nominālo saules iedarbību. Atšķirībā no citām tetraciklīna antibiotikām, kas dažkārt var izraisīt nopietnus nieru bojājumus, tomēr tās parasti var droši lietot pacientiem ar pavājinātu nieru darbību. Visas tetraciklīna grupas antibiotikas nekad nedrīkst lietot vai ievadīt pēc zāļu derīguma termiņa beigām. Šo zāļu ražošanā izmantotās sastāvdaļas laika gaitā sadalās, veidojot toksīnus, kas ir īpaši bīstami nierēm.