Atšķirība starp sintaksi un morfoloģiju ir tāda, ka sintakse nodarbojas ar teikumu struktūru, bet morfoloģija – ar vārdu struktūru. Jebkurā valodā pastāv noteikumi, kas nosaka vārdu salikšanu. Tie ir sintakses noteikumi. Morfoloģija ir pētījums par to, kā vārdi tiek veidoti un saprasti valodā. Gan sintakse, gan morfoloģija ir saistītas ar to, kā nozīme tiek radīta ar valodu.
Sintakse ir jēdziens, kas regulē teikumu struktūru. Vārdu salikšanas secība ietekmē teikuma nozīmi kopumā. Lai teikums būtu gramatiski pareizs un saprotams valodas runātājiem, ir jāievēro sintakses noteikumi. Tas nosaka tādas lietas kā priekšmeta un darbības vārda secība, kā arī īpašības vārdu un apstākļa vārdu izmantošana.
Morfoloģija ir morfēmu izpēte, kas ir mazākā nozīmes vienība valodā. Morfēma var būt viens vesels vārds vai priedēklis vai sufikss, kas tiek saprasts, lai mainītu vārda nozīmi, un tāpēc tas iegūst pašu nozīmi. Morfoloģija ietver locījuma un atvasinājuma jēdzienus, kas ļauj vārdus padarīt daudzskaitļa formā vai mainīt vārda laiku. Morfoloģijas pētījums mēģina saprast, kā cilvēki lieto un saprot vārdu darbības veidu, mēģinot saprast atšķirību, ko viena morfēma rada daudziem vārdiem un kā vārdi ir saistīti viens ar otru.
Gan sintakse, gan morfoloģija ir svarīgas tam, kā cilvēki iegūst nozīmi no valodas, taču tās atšķiras ar to, ka sintakse attiecas uz vārdu secību un lietojumu, un morfoloģija attiecas uz vārdu daļām, kas rada nozīmi. Piemēram, ir iespējams izveidot teikumu, kas ir gramatiski pareizs, bet valodas runātājam nav jēgas. Tas ir iespējams, jo sintakse regulē tikai teikuma secību, nevis to, ko tajā esošie vārdi nozīmē. No otras puses, vārdu kombinācijai var būt jēga, ja to lieto kopā, taču tās var zaudēt nozīmi, ja tās tiek pārkārtotas tādā veidā, kas pārkāpj sintakses noteikumus. Sintakse un morfoloģija ir atšķirīgas, bet ir atkarīgas viena no otras.