Saikne starp amerikāņu futbolu un smadzeņu bojājumiem galvenokārt rodas tāpēc, ka futbolisti savas darbības laikā var gūt vienu vai vairākus smadzeņu satricinājumus, kas var izraisīt ilgstošus ievainojumus un smadzeņu darbības traucējumus. Visvairāk satrauc tas, ka spēlētājiem var attīstīties stāvoklis, ko sauc par hronisku traumatisku encefalopātiju (CTE), ko nevar diagnosticēt, kamēr kāds nav miris. CTE savulaik galvenokārt bija saistīta ar boksu, un lielais sitienu skaits indivīdiem bija pa seju un galvu, izraisot vairākus smadzeņu satricinājumus. Diemžēl futbols un šāda veida smadzeņu bojājumi ir arvien vairāk saistīti, jo vairāk futbolistu ir diagnosticēti CTE pēc bieži vien priekšlaicīgas nāves.
Amerikāņu futbols neapšaubāmi ir agresīvs sporta veids, un pat tad, ja valkā ķiveri, pastāv liels nopietnas galvas traumas risks. 2000. gados savāktie pierādījumi ir likuši profesionālajām līgām mēģināt samazināt smadzeņu satricinājumus un mainīt to ārstēšanas protokolu. Piemēram, spēlētāji, kuriem tika noteikts smadzeņu satricinājums, vairs nevar vienkārši atkal pievienoties spēlei, jo viņi jūtas labāk, kas bija pieļaujams 1990. gados. Labāka izpratne par futbolu un smadzeņu bojājumiem liecina, ka smadzeņu satricinājuma simptomi ne vienmēr rodas uzreiz pēc traumas, un ir nepieciešama piesardzīgāka nostāja, lai noteikti bojājumi nebūtu nozīmīgi.
Pagaidām nav zināms, cik daudz traumu spēlētājs var gūt, pirms smadzeņu bojājumi kļūst pastāvīgi. Īpašs CTE cēlonis ir proteīnu uzkrāšanās smadzenēs, kas ietekmē to darbību. Šķiet, ka šī olbaltumvielu agregācija ievērojami palielinās, ja galva tiek ievainota biežāk. Nav zināms, vai visi cilvēki ar daudzām galvas traumām saslimst ar šo stāvokli, taču ir skaidrs, ka futbolisti ietilpst augsta riska grupā, jo regulāri gūst smadzeņu satricinājumus.
CTE simptomi ilustrē futbola un smadzeņu bojājumu saistību ignorēšanas nopietnību. Šis stāvoklis var sākties ar garastāvokli, dusmu vadības problēmām, impulsu kontroles problēmām un smagu depresiju. Daži cilvēki agrīnā stadijā izdara pašnāvību. Progresējot, CTE sāk atgādināt Alcheimera slimību, samazinot fizisko kustību un simptomus, piemēram, delīriju un demenci.
Pieaugošā izpratne par saistību starp vidusskolu, koledžu un profesionālo futbolu un smadzeņu bojājumiem ir radījusi vairākas idejas par to, kā šī problēma būtu jārisina. Daži ir ierosinājuši, ka, iespējams, cilvēkiem nevajadzētu turpināt spēlēt, ja viņi saņem otru smadzeņu satricinājumu. Šī ideja parasti nav populāra.
Vēl viens piedāvātais risinājums ir izstrādāt ķiveres, kas vairāk aizsargā spēlētāju galvas un vairāk novērš smadzeņu satricinājumus. Tika norādīts, ka ķiveres konstrukcija nav tik moderna, un pārveidota ierīce varētu būt labāka. Šīs idejas joprojām nenovērš pamata riskus, kas saistīti ar tādu kontaktu sporta veidu kā futbols, un nav skaidrs, vai tās būs veiksmīgas CTE novēršanā.
Spēcīgākā saikne starp futbolu un smadzeņu bojājumiem slēpjas dažu CTE upuru vārdos, piemēram, Tampabejas Buccaneer, Tom McHale; Maiami delfīns, Džons Grimslijs; un Sinsinati Bengālija, Kriss Henrijs. Citi spēlētāji, kuriem pēcnāves analīzē CTE ir bijuši pozitīvi, ir Deivs Duersons, Maiks Vebsters un Lū Kērmūrs. Nav zināms, cik daudz esošo vai bijušo spēlētāju dzīvo ar šo stāvokli vai ir pakļauti riskam to attīstīt.