Probiotikas un fermenti darbojas tandēmā kuņģa-zarnu traktā. Abi noārda pārtiku, tādējādi palīdzot labākai gremošanu. Tomēr enzīmi iet vienu soli tālāk. Tie baro probiotikas un ļauj tiem palikt dzīvam un vairoties. Tas ir tāpēc, ka probiotikas ēd blakusproduktus, kas rodas, fermentiem ķīmiski sagremot pārtiku, sadalot tos vienkāršās uzturvielās, kuras probiotikas var viegli absorbēt.
Pārtika, ko fermenti rada probiotiku atbalstam, ietver taukskābes, vienkāršus ogļhidrātus un aminoskābes. Pārtikas apmaiņa starp probiotikām un fermentiem ietver arī dažādas minerālvielas un vitamīnus, ko ražo fermenti. Ir deviņi dažādi fermentu veidi, kas ražo šos uztura blakusproduktus. Tie darbojas specializētās kuņģa-zarnu trakta zonās, piemēram, resnajā zarnā, tievā zarnā un aizkuņģa dziedzerī.
Proteāze, amilāze un lipāze tiek uzskatīti par trim galvenajiem gremošanas enzīmiem. Lipāze sagremo taukus, kas pazīstami kā lipīdi, un ražo taukskābes kā šīs gremošanas blakusproduktu. Amilāzes uzdevums ir mērķēt uz cieti un ogļhidrātiem, sadalot tos vienkāršos cukuros, kas ir pietiekami pamata, lai probiotikas varētu viegli patērēt. Proteāze, īpaši proteāzes enzīms, kas pazīstams kā pepsīns, sagremo olbaltumvielas, lai ražotu aminoskābes.
Sekundārie gremošanas enzīmi ir saharāze, maltāze un laktāze. Laktāze sagremo piena cukuru, ko sauc arī par laktozi. Maltāze ķīmiski samazina iesala cukuru, kas pazīstams kā maltoze, līdz glikozei. Saharāze sagremo saharozi, veidojot fruktozi vai glikozi. Pārējie enzīmi ogļhidrāze, pektināze un hemicelulāze tiek uzskatīti par nenozīmīgiem probiotikām, lai gan tie palīdz cilvēka ķermenim gremošanu.
Aminoskābes un cietes, kas rodas ķīmiskajā šķelšanā, ir noderīgas ne tikai probiotikām un fermentiem. Cilvēki šo uzturu var uzņemt arī caur orgānu oderēm. Proteāzes enzīmi galvenokārt kalpo probiotiskajām laktobacillām tievajās zarnās, kur aminoskābes var nokļūt caur membrānu asinsritē. Tikmēr amilāze ir saistīta ar probiotikām aizkuņģa dziedzerī un siekalu dziedzeros, kur amilāzes izdalītie vienkāršie cukuri var tikt absorbēti caur muti vai aizkuņģa dziedzera membrānu.
Kaut arī gan probiotikas, gan fermenti pārvērš pārtiku enerģijā, izmantojot gremošanu, tas nav galvenais probiotiku ieguvums. Probiotikas aizsargā imūnsistēmu un palielina tās efektivitāti, izvadot toksīnus un kaitīgās baktērijas. Kā detoksikācijas līdzeklis probiotikas ir slavētas par to, ka tās novērš dažādas kaites, sākot no alerģijām līdz resnās zarnas vēzim. Šie labvēlīgie mikroorganismi var palīdzēt organismam uzveikt kaitīgās baktērijas, piemēram, salmonellu un E.coli. Jo vairāk pārtikas viņi saņem no fermentiem, jo vairāk probiotikas var vairoties un nodrošināt veselības aizsardzību.
Cilvēkiem novecojot vai izturot slimības, probiotiku daudzums organismā var strauji samazināties. Papildinājumi ar probiotikām un fermentiem var veicināt organisma labvēlīgo mikrofloru. Tiem, kas lieto uztura bagātinātājus vai dzīvu pārtiku, lai palielinātu probiotiku un enzīmu līmeni organismā, parasti ir jāsaglabā konsekventi, jo gan probiotikas, gan fermenti organismā tiek regulāri izsmelti, un tie ir jāpapildina.
Daži papildu probiotiku un enzīmu kritiķi apgalvo, ka fermenti, īpaši proteāze, iznīcinās dažas uz proteīnu balstītas probiotikas. Tomēr daudzi pētījumi atspēko šo apgalvojumu. Lai izvairītos no kaitīgas mijiedarbības, daudzi uztura speciālisti iesaka lietot fermentus pirms ēšanas un probiotikas pēc tam.