Lai gan beta blokatori var būt ļoti noderīgi asinsspiediena pazemināšanai un noteiktu sirds slimību ārstēšanai, tie ne vienmēr ir ideāla ārstēšana. Ir rūpīgi jāizvērtē beta blokatoru kontrindikācijas, jo zāles var pasliktināt dažus stāvokļus vai maskēt komplikāciju simptomus. Dažas no beta blokatoru kontrindikācijām ir diabēts, astma, daļēja sirds blokāde un lēna sirdsdarbība.
Viena no visizplatītākajām beta blokatoru kontrindikācijām ir I vai II tipa cukura diabēta esamība. Diabētiķiem ir nosliece uz stāvokli, kas pazīstams kā hipoglikēmija vai ārkārtīgi zems cukura līmenis asinīs, par ko var liecināt tādi simptomi kā reibonis, drebuļi un paātrināta sirdsdarbība. Tā kā beta blokatori darbojas, samazinot adrenalīna līmeni asinīs un palēninot sirdsdarbības ātrumu, zāles var maskēt svarīgus hipoglikēmijas simptomus. Šī iemesla dēļ beta blokatorus reti izraksta diabēta slimniekiem, īpaši tiem, kuriem reti rodas hipoglikēmijas ārējie simptomi.
Meklējot beta blokatorus, lai samazinātu asinsspiedienu, tie var izraisīt arī elpceļu sašaurināšanos, ko sauc par bronhokonstrikciju. Šī darbība var apgrūtināt elpošanu, kas var nebūt problēma veseliem pacientiem, bet var radīt postījumus pacientiem ar astmu. Astma ir viena no vissvarīgākajām kontrindikācijām beta blokatoriem, jo šo zāļu lietošana var izraisīt pēkšņas, vardarbīgas astmas lēkmes, kas var izraisīt hospitalizāciju un nāvi. Pat pacientiem ar vieglu astmu vai tiem, kuriem astma ir bijusi bērnībā, bet ne pieaugušā vecumā, var ieteikt nelietot beta blokatorus.
Blakusparādības no beta blokatoriem ietver dažas kardiovaskulāras izmaiņas, kas var radīt briesmas pacientiem ar sirds slimībām. Sirds un asinsvadu kontrindikācijas beta blokatoriem bieži ietver sirds blokādi, stāvokli, kurā elektriskie signāli no sirds kambariem ne vienmēr pārraida pareizi, izraisot neregulāru sirdsdarbību. Beta blokatori var palielināt neregularitāti, pasliktinot sirds blokādi un palielināt sirds mazspējas vai nestabila sirds ritma iespējamību.
Lēnāka sirdsdarbība, kas pazīstama kā bradikardija, var būt bīstama arī tad, ja to kombinē ar beta blokatoriem. Tā kā šo zāļu galvenā darbība ir samazināt sirdsdarbības ātrumu, bradikardija var izraisīt ārkārtīgi zemu sirdsdarbības ātrumu, kas nav ilgtspējīgs. Gadījumos, kad beta blokatori tiek parakstīti neatkarīgi no šīs kontrindikācijas, pacientiem var rasties smagākas zāļu blakusparādības, un viņiem var būt paaugstināts sirds mazspējas risks.