Visbiežākās endometrija ablācijas blakusparādības ir drudzis, krampji un slikta dūša tūlīt pēc operācijas. Tāpat nav nekas neparasts, ka sievietes, kurām tiek veikta šī procedūra, pēc ablācijas operācijas īslaicīgi, parasti tikai dažas dienas, piedzīvo nogurumu un biežu urinēšanu. Pacienti tiek informēti, ka grūtniecība pēc endometrija ablācijas ir maz ticama, lai gan, ja tā notiek, pastāv augsts spontāna aborta risks. Endometrija vai dzemdes ablāciju parasti veic sievietēm ar neregulāru menstruālo ciklu, kam raksturīgs neparasti liels asins zudums cikla laikā. Operāciju bieži veic pacientiem ar tādiem stāvokļiem kā endometrioze, un to veic tikai pēc tam, kad citas konservatīvākas ārstēšanas metodes nav devušas rezultātus.
Endometrija ablācijas procedūra ir paredzēta, lai iznīcinātu plānu dzemdes gļotādas slāni, kas bieži izraisa neauglību. Pēc bioloģisko audu noņemšanas pacienta menstruālais cikls vai nu pilnībā apstājas, vai arī ievērojami samazinās tā smagums un zaudēto asiņu daudzums. Ir pieejamas vairākas ablācijas metodes, tostarp oderes slāņa sasaldēšana, karsēta šķidruma izmantošana un lāzerķirurģija.
Lielākajai daļai pacientu novēro parastās endometrija ablācijas blakusparādības, piemēram, sāpes, krampji un slikta dūša. Vairumā gadījumu šie simptomi ir īslaicīgi un bieži vien ilgst apmēram četras dienas. Ablācijas pacienti bieži saskaras ar zemu drudzi, kā arī noguruma sajūtu. Daudzas sievietes pamana plānu, ūdeņainu, asiņainu izdalīšanos arī stundās un dienās pēc operācijas. Tāpat kā citas izplatītās endometrija ablācijas blakusparādības, šīs sekas parasti nav ilgstošas, un pacients ātri atveseļojas.
Sievietēm, kuras tiek ieteiktas endometrija ablācijai, procesa sākumā tiek ieteikts, ka šī procedūra, visticamāk, izraisīs neauglību, lai gan grūtniecība var iestāties reti. Grūtniecības gadījumā pēc endometrija ablācijas lielākā daļa grūtniecību spontāni pārtrūks vai spontāni. Pat šajos gadījumos fiziskais apdraudējums sievietei ir minimāls; tomēr lielākā daļa ārstu rūpējas par pacienta emocionālo veselību. Šī iemesla dēļ daži ārsti iesaka ablācijas pacientiem izmantot alternatīvus dzimstības kontroles veidus, lai novērstu grūtniecību pēc atveseļošanās pēc procedūras.
Lai gan lielākā daļa pacientu pēc operācijas atgūstas bez grūtībām vai bez grūtībām, ir pierādījumi par nopietnākām endometrija ablācijas blakusparādībām. Pacienti ir sūdzējušies par menstruācijām līdzīgām sāpēm krampju dēļ, nogurumu un muguras sāpēm, kas rodas mēnešus pēc procedūras. Citi iespējamie, bet reti iespējamie endometrija ablācijas riski ietver arī infekciju no operācijas un ilgstošu, smagu asiņošanu.