Daži zinātniskās pētniecības kopienas locekļi ierosina, ka cilmes šūnu terapijas izmantošana autismam izraisa normālu smadzeņu šūnu atjaunošanos un orgānu skābekļa plūsmas palielināšanos. Vairumā gadījumu kognitīvo traucējumu ārstēšanā tiek izmantotas cilmes šūnas no nabassaites. Tiek uzskatīts, ka cilmes šūnas arī apkaro dažus iespējamos autisma ģenētiskos veicinātājus, piemēram, patoloģisku veidošanos un iekaisumu šūnās, kas ietekmē kognitīvo attīstību.
Autisms un ar autismu saistīti traucējumi, piemēram, Aspergera sindroms, var izraisīt aizkavēšanos un traucējumus cilvēka spējā socializēties, sazināties un attīstīt normālas dzīves prasmes. Šķiet, ka traucējumi ietekmē valodas attīstību un var ietekmēt indivīda izpratni un interpretāciju par sociālajām norādēm un pieņemamu sociālo uzvedību. Daži medicīnas pētnieki un attīstības traucējumu praktiķi uzskata, ka dažus no šiem efektiem var novērst, izmantojot autisma cilmes šūnu terapiju. Šāda veida terapija ievada cilvēka cilmes šūnas pacienta sistēmā, cerot, ka šīs šūnas izraisīs jaunu, nebojātu audu augšanu smadzenēs.
Viens no iespējamiem autisma cēloņiem ir patoloģiska šūnu dalīšanās un augšana tajās smadzeņu daļās, kas ietekmē saziņu un valodas attīstību. Rezultātā tie, kam diagnosticēti traucējumi, mēdz uzvesties tā, kā lielākajai daļai sabiedrības varētu šķist neparasti vai grūti interpretējami. Piemēram, tipiskas autisma agrīnās pazīmes ietver ārkārtēju atslābināšanos un nespēju runāt un atbildēt tipiskā veidā. Lai gan terapija bieži var ietvert uzvedības metodes, piemēram, lēnu indivīdu pieradināšanu pie sociālās mijiedarbības, cilmes šūnu terapija autisma gadījumā mēģina izmantot ķermeņa dabisko reģenerācijas procesu, lai aizstātu patoloģiskas šūnas, lai atjaunotu dažas valodas un kognitīvās spējas.
Tiek uzskatīts, ka iespējamie ieguvumi no cilmes šūnu terapijas autisma gadījumā parādīsies, jo terapija ietver pakāpenisku normālu smadzeņu audu atjaunošanos. Tā vietā, lai dublētu esošo ģenētisko kodu vai patoloģiskas īpašības, šīs cilmes šūnas pāraug pilnībā funkcionālos audos un tiek uzskatīts, ka galu galā tās aizvieto bojātās šūnas. Ir pierādīts, ka autisma ārstēšanā cilmes šūnas palielina skābekļa daudzumu smadzenēs, kas var radīt stabilāku vidi veselīgu audu attīstībai.
Lai gan autisma cilmes šūnu terapija ir izrādījusi zināmu solījumu, tā nav plaši atzīta par pieņemamu vai adekvātu slimības ārstēšanu. Autisma skartās personas joprojām lielākoties tiek ārstētas, izmantojot individualizētas izglītības programmas un uzvedības dzīves prasmju nodarbības, kas var koncentrēties uz tādām tēmām kā ēdiena gatavošana un personīgā higiēna. Tiem, kuriem ir autisms un ar to saistītie traucējumi, smagums un simptomi var ievērojami atšķirties. Daži spēj sazināties un iegūt darbu, savukārt citi nespēj runāt bez tehnoloģiju vai alternatīvu saziņas metožu palīdzības.