Migrēnas simptomi bērniem var atšķirties atkarībā no migrēnas veida, taču ir daudz tādu, kas ir izplatīti neatkarīgi no veida. Galvenie simptomi ir stipras galvassāpes, jutīga galvas āda, jutība pret gaismu un skaņu un aizkaitināmība. Kopumā migrēna bērniem izpaužas četrās fāzēs – prodromā, aurā, galvassāpēs un postdromā – katrai ar savu unikālo simptomu kopumu.
Galvenais migrēnas rādītājs bērniem ir pēkšņas vai pulsējošas galvassāpes galvas priekšpusē vai abās galvas pusēs. Arī galvas āda var būt jutīga, īpaši apgabalā, kur galvassāpes ir vissmagākās. Daudzi bērni arī izjūt jutību pret gaismu un skaņām. Citas vispārīgas pazīmes ir aizkaitināmība, bāla āda un vēlme apgulties.
Pirmo migrēnas fāzi bērniem sauc par prodromu jeb priekšnosacījumu fāzi, kas pirms migrēnas lēkmēm ir līdz 24 stundām. Bērni šajā fāzē var piedzīvot garastāvokļa izmaiņas, piemēram, aizkaitināmību, pacilātību un depresiju. Viņi var būt runīgāki vai sociāli noslēgtāki nekā parasti. Viņiem var būt arī palielināta vai samazināta apetīte un slāpes, kā arī traucēts miegs. Bērni ar biežu migrēnu bieži saprot, ka kaut kas ir savādāk vai nepareizi, taču viņiem var būt grūtības izskaidrot, kas tieši notiek.
Otrajā fāzē ir iesaistītas auras, lai gan tas parasti notiek tikai aptuveni 10% līdz 20% bērnu, kuriem ir migrēna. Šī fāze notiek tieši pirms vai kopā ar galvassāpēm, un ļoti dažādi simptomi ilgst no piecām līdz 20 minūtēm. Migrēna bērniem šajā fāzē var likt viņiem redzēt vizuālo auru, kas kustas vai maina formas. Dažādi auru veidi ietver neskaidru redzi, zigzaga līnijas, dzirksteles vai gaismas zibšņus, melnus punktus un krāsu modeļus. Papildu simptomi, kas bērniem var rasties, ir izmainīta laika izjūta, sapņainas sajūtas, uzmanības zudums, apjukums un aizmāršība.
Galvassāpes rodas trešajā fāzē un var ilgt no 30 minūtēm līdz 48 stundām, lai gan parasti tās ilgst mazāk nekā četras stundas. Ir daudz simptomu, kas var rasties kopā ar galvassāpēm, piemēram, slikta dūša, drebuļi, anoreksija un vemšana, caureja un aizcietējums. Citi simptomi var būt jutība pret gaismu, skaņām un smaržām, kā arī atmiņas zudums un apjukums.
Postdroms, kas ir pēdējā fāze, notiek pēc migrēnas lēkmes beigām un var ilgt no stundām līdz dienām. Šī ceturtā migrēnas fāze bērniem parasti liek viņiem justies izsmelti un vāji. Tomēr dažos gadījumos bērni var justies pacilāti un viņiem var būt enerģijas pieplūdums.