Narkolepsija ir neparasts stāvoklis, kad smadzenes slikti regulē bioloģiskos miega un nomoda modeļus. Pacientiem ir tendence uz pārmērīgu miegainību dienas laikā un ātri ieslīgst dziļā snaudā, kur viņu muskuļi var īslaicīgi tikt paralizēti. Neskatoties uz daudzu gadu mūsdienu pētījumiem, precīzi narkolepsijas cēloņi joprojām nav skaidri. Šis traucējums gandrīz noteikti ir specifisku ģenētisku mutāciju rezultāts, un jaunākie pētījumi ir bijuši tuvu iesaistīto gēnu noteikšanai un izskaidrošanai, kā tie izraisa simptomus. Turklāt vairāki dažādi vides faktori var palielināt miega traucējumu attīstības iespējamību, ja ir sākotnējie narkolepsijas ģenētiskie cēloņi.
Lielākā daļa miega ekspertu uzskata, ka galvenie narkolepsijas cēloņi ir saistīti ar ģenētiskajām mutācijām sestajā hromosomā. Ir padziļināti pētīta hromosomu gēnu grupa, ko sauc par cilvēka leikocītu antigēna (HLA) kompleksu. HLA komplekss galvenokārt ir iesaistīts cilvēka imūnsistēmas darbības uzturēšanā. Šķiet, ka daudziem cilvēkiem ar narkolepsiju HLA gēnu mutācijas izraisa autoimūnas reakcijas, kas uzbrūk neironiem, kas pārnēsā hipokretīnu, svarīgu ķīmisku vielu, kas veicina nomodā. Ja nav pietiekami daudz hipokretīna, smadzenes nespēj uzturēt normālus miega un nomoda modeļus.
Ir noteikti arī citi narkolepsijas ģenētiskie cēloņi. Pētījumos ar suņiem pētnieki atklāja, ka 12. hromosomas mutācijas var pasliktināt hipokretīna nervu receptoru vietas. Nervu šūnu nāves vietā hipokretīna trūkumu izraisa neironu nespēja to absorbēt. Pašreizējie pētījumi cer labāk noskaidrot saikni starp hipokretīnu, narkolepsiju un nervu darbību.
Ar ģenētiku vien parasti nepietiek, lai izraisītu narkolepsiju. Citi faktori, piemēram, traumatiski smadzeņu ievainojumi un audzēji, var pasliktināt smadzeņu daļas, kas regulē miega ciklus, apziņu un muskuļu kontroli. Jo īpaši hipotalāma un tilta bojājumi smadzeņu stumbrā ir cieši saistīti ar narkolepsijas simptomu izpausmi dažiem pacientiem. Arī bioloģiskie faktori, kas saistīti ar hormonālo nelīdzsvarotību un ilgstošiem stresa periodiem, var veicināt traucējumus.
Vides faktori ir arī iespējamie narkolepsijas izraisītāji vai cēloņi pacientiem, kuriem ir ģenētiska nosliece uz hipokretīna deficītu. Smagas vīrusu infekcijas, smēķēšana, piesārņotāju iedarbība un slikta uztura izvēle, kas izraisa aptaukošanos, ir saistītas ar narkolepsijas simptomiem. Iespējams, ka turpmākie ģenētiskie pētījumi un klīniskie pētījumi atklās vairāk informācijas par mutāciju un vides faktoru lomu smadzeņu ķīmisko vielu mainīšanā un traucējumu izpausmēs.