Flegma plaušās bieži izraisa produktīvu klepu, un tas parasti ir saistīts ar vairākiem apstākļiem. Viens no biežākajiem tās cēloņiem ir pneimonija, taču to var izraisīt arī alerģiska bronhopulmonālā aspergiloze un ar AIDS saistītas plaušu infekcijas. Tiem, kuriem iepriekš ir diagnosticēts AIDS un kuriem pašlaik ir klepus, kas izraisa flegmu, jākonsultējas ar savu veselības aprūpes komandu, lai izvairītos no nopietnām komplikācijām.
Viens no biežākajiem flegma cēloņiem plaušās ir pneimonija. Pneimoniju parasti definē kā plaušu iekaisumu, un to bieži izraisa dažādu vīrusu vai baktēriju veidu iedarbība. Tomēr dažos gadījumos pneimonija var attīstīties arī rauga infekcijas dēļ. Tā kā pneimonijas simptomi kļūst arvien smagāki, krasi palielinās flegma daudzums, kas uzkrājas plaušās. Neskatoties uz plaši izplatīto uzskatu, pneimonija rodas ne tikai rudenī vai ziemā, bet faktiski var attīstīties jebkurā laikā. Papildus lielam plaušu flegma daudzumam citi bieži sastopami simptomi, kas saistīti ar šo slimību, ir hronisks klepus un vispārējs vājums.
Alerģiska bronhopulmonārā aspergiloze ir vēl viens stāvoklis, kas parasti ir saistīts ar liela daudzuma flegma veidošanos plaušās. Šis stāvoklis rodas pacientiem, kuriem attīstās alerģiska reakcija pret sēnīti, kas pazīstama kā aspergillus, kas var viegli pārvietoties pa gaisu. Pacienti, kuriem ir diagnosticēts šis stāvoklis, papildus flegmam var atklepot arī nelielas, brūnas pārslas. Var būt grūti izvairīties no alerģiskas reakcijas pret aspergillus, jo tā parasti atrodama nokaltušajās lapās, kokos, kompostā un citos augu veidos. Turklāt tas ir atrodams arī apkures kanālos, gaisa kondicionieros un pat paklājos.
Dažos gadījumos flegma plaušās var izraisīt dažādas plaušu infekcijas, kas parasti ir saistītas ar AIDS. Tiem, kuriem ir diagnosticēts HIV vai AIDS un kuriem attīstās plaušu infekcija, sākotnēji var rasties sauss klepus, bet, stāvoklim attīstoties, plaušās sāk veidoties liels daudzums flegma. Daži no visizplatītākajiem ar AIDS saistīto plaušu infekciju veidiem ir tuberkuloze, plaušu audzēji, pneimocistīta pneimonija un mycobaterium avium komplekss. Personām, kurām diagnosticēts AIDS un kurām ir palielināts plaušu flegma daudzums, nekavējoties jāmeklē medicīniskā palīdzība, lai novērstu turpmākas šī stāvokļa komplikācijas.