Daudzi kafijas eksperti saka, ka labākā kafija sākas ar tīrāko aprīkojumu. Izmantojot netīru kafijas automātu, pat visdārgākā kafija var kļūt rūgta vai novecojusi, tāpēc ir svarīgi regulāri tīrīt pilienveida kafijas automātu, lai iegūtu dzeramu dzērienu. Pilienu kafijas automāta tīrīšana nav grūts process, lai gan dažiem tas var šķist nedaudz laikietilpīgs. Svarīgākās sastāvdaļas, kas jāpatur pa rokai, tīrot pilienveida kafijas automātu, ir tīra ūdens un baltā etiķa padeve.
Tradicionālais kafijas automāts nesatur daudz kustīgu detaļu, kuras ir jāizjauc, lai veiktu rūpīgu tīrīšanu. Tomēr ir dažas vietas, kurās ir tendence savākt eļļainus atlikumus no pagatavotām kafijas pupiņām, un citās vietās, kur var veidoties katlakmens no neapstrādāta cieta ūdens. Nolaidība var izraisīt arī miltrasas un pelējuma veidošanos, ja kafijas filtri un to izlietotais saturs netiek nekavējoties izņemti. Pareiza kafijas automāta tīrīšana nozīmē visu, sākot no stikla karafes un beidzot ar ūdens padeves sistēmu.
Lai notīrītu stikla karafi, kurā atrodas gatavā kafija, cilvēks ar mīkstu plastmasas birsti var pavirpināties ap iekšpusi ar nelielu daudzumu ziepjūdens un pēc tam vairākas reizes izskalot to ar tīru ūdeni, līdz ziepju atlikumi ir pilnībā pazuduši. Šī metode var piešķirt kafijai nepatīkamu garšu, tomēr daudzi cilvēki karafi tīrot cenšas izvairīties no ķimikāliju lietošanas.
Alternatīva tīrīšanas metode, ko izmanto daudzi restorāni, ietver ledus gabaliņu, rupjas sāls un citronu sulas izmantošanu. Šo maisījumu var pievienot netīrai kafijas karafei un virināt vairākas minūtes, lai noņemtu visas piedegušās kafijas atliekas vai eļļas uzkrāšanos. Pēc dažām minūtēm ledus maisījumu var iemest izlietnē un vairākas reizes izskalot karafi ar tīru ūdeni.
Faktiskā kafijas automāta tīrīšanai nepieciešama cita pieeja. Iekārtas daļa, kurā atrodas kafijas filtrs, ir jānoņem un jāpārbauda, vai nav piesārņojuma. Visi vecie filtri vai biezumi nekavējoties jāizmet. Lietotājam jānomaina filtra turētājs, taču tīrīšanas procesa laikā filtrs nav jāizmanto. Tīrai kafijas karafei ir jābūt vietā, lai tā saņemtu tīrīšanas šķīdumu, kad tas pārvietojas pa kafijas automātu.
Lietotājam kafijas automāta ūdens tvertnē jāpievieno baltā etiķa un ūdens maisījums. Avoti nav vienisprātis par pareizu ūdens un etiķa attiecību, taču parasti ikdienas tīrīšanai vajadzētu pietikt ar divām daļām ūdens uz vienu daļu baltā etiķa. Tomēr īpaši netīri kafijas automāti var gūt labumu no vienādām daļām etiķa un ūdens. Balto etiķi var ievietot tieši tvertnē, pēc tam atšķaidīt ar ūdeni, līdz iekārta ir pilna.
Nākamais solis ir palaist normālu kafijas ciklu ar etiķa un ūdens maisījumu. Šķīdumam vienmērīgi jāpil karafē, un tas, visticamāk, šķitīs tumšs vai duļķains, noņemot eļļainās atliekas un netīrumus. Kad šis cikls ir beidzies, lietotājs var izmest karafes saturu un sākt otru ciklu ar svaigu baltā etiķa un ūdens padevi. Ja gatavais ūdens karafē joprojām izskatās duļķains vai tumšs, var noderēt trešais cikls, taču bieži vien vajadzētu pietikt ar diviem tīrīšanas cikliem.
Kad pēdējais tīrīšanas cikls ir pabeigts, lietotājam jāsāk vairāki tīra skalošanas ūdens cikli, lai noņemtu visas etiķa pēdas. Rezultātā ir jābūt ļoti tīram kafijas automātam, kam jāļauj kārtīgi nožūt pirms nākamās kafijas kannas palaišanas. Daži kafijas dzērāji var uzreiz pamanīt izteiktus uzlabojumus kopējā kafijas pagatavošanas kvalitātē, taču dažkārt izmaiņas ir smalkākas. Citi faktori, piemēram, ūdens temperatūra, kafijas pupiņu maluma lielums un filtra kvalitāte, var ietekmēt arī pagatavotās kafijas garšu, taču kafijas automāta pareiza tīrīšana var palīdzēt ārkārtīgi daudz.