Alternatīvās tirdzniecības sistēmas ir sistēmas, ko izmanto vērtspapīru tirdzniecībai. Tos apstiprina Vērtspapīru un biržu komisija, bet tie darbojas ārpus tradicionālajām biržām. Saskaņā ar Vērtspapīru un biržu komisijas nolikumu ATS alternatīva tirdzniecības sistēma ir “jebkura organizācija, asociācija, persona, personu grupa vai sistēma, kas veido, uztur vai nodrošina tirgus vietu vai iekārtas, lai apvienotu vērtspapīru pircējus un pārdevējus vai citādi attiecībā uz vērtspapīriem pildot funkcijas, ko parasti veic birža.
Elektronisko sakaru tīkls (ECN) ir alternatīva akciju un valūtu tirdzniecības sistēma. ECN tiek izmantots aktīvai tirdzniecībai, tirdzniecības sistēmai saskaņojot pirkšanas un pārdošanas rīkojumus. Pasūtījumi, kurus nevar saskaņot, tiek parādīti, lai interesenti varētu iesniegt atbilstošus pasūtījumus. Privātpersonas vai brokeri var abonēt elektronisko sakaru tīklu. Instinet ir pirmais un lielākais elektronisko sakaru tīkls.
Alternatīvas tirdzniecības sistēmas ir noderīgas starptirgu tirdzniecībai, jo akcijas, kas kotētas citā biržā, piemēram, Ņujorkas biržā (NYSE) vai Nasdaq, var tirgot elektronisko sakaru tīklos. Izmaksas, kas saistītas ar tirdzniecību alternatīvā tirdzniecības sistēmā, mēdz būt zemākas, jo darījumi tiek veikti elektroniski. Vairāk cilvēku var piekļūt tirgum, izmantojot alternatīvas tirdzniecības sistēmas, nekā izmantojot centralizētu tirgu, piemēram, NYSE. Tas nozīmē, ka alternatīvās tirdzniecības sistēmās tirgoto vērtspapīru cenas teorētiski vairāk atspoguļos to patieso vērtību, jo brīvā tirgus piedāvājuma un pieprasījuma spēki darbojas neierobežoti.
Ja institucionālais investors vēlas pirkt vai pārdot lielu daudzumu konkrēta vērtspapīra, izmantojot crossing network, alternatīvas tirdzniecības sistēmas veidu var dot priekšroku, nevis veikt darījumu tradicionālajā biržā. Liela akciju bloka pirkšana vai pārdošana tradicionālā biržā bieži var mainīt šī vērtspapīra cenu. Tirdzniecība šķērsošanas tīklā, kas saskaņo rīkojumus, nevirzot tos caur biržas vai elektronisko sakaru tīklu, to nedarīs, jo pirkšanas un pārdošanas rīkojumi tiek saskaņoti un izpildīti anonīmi. Šīm alternatīvajām tirdzniecības sistēmām nepiemīt īpašība cenu solīšanai augšup vai lejup, kā tas ir centralizētajiem tirgiem.
Cits alternatīvās tirdzniecības sistēmas veids ir zvanu tirgus. Zvanu tirgū daudzi pasūtījumi tiek sagrupēti. Kad rīkojumi sasniedz noteiktu apjomu, rīkojumu grupa tiek izpildīta vienlaicīgi. Tas palielina efektivitāti un samazina izmaksas.