Kas ir augu genoms?

Katrs genoms, ieskaitot augu genomu, sastāv no nukleotīdu virknes, kas veido šī organisma DNS. DNS ir četru veidu nukleotīdi, kas ir alanīns (A), timīns (T), guanīns (G) un citozīns (C). Nukleotīdu virknes var būt ļoti garas, un to secība veido gēnus. Vienas garas DNS virknes vietā gēni ir sagrupēti hromosomās, kas atrodas katras organisma šūnas kodolā. Dažādām organismu sugām ir ne tikai dažādi gēni, bet arī atšķirīgs hromosomu skaits.

Zinātnieki daudzus gadus ir pētījuši genomus. Ģenētiķi ir mēģinājuši atrast gēnus, kas kodē konkrētas dzīvo būtņu pazīmes un funkcijas. Vēl nesen viņiem bija ierobežots tas, ko viņi var atrast, bet tagad viņi ir izstrādājuši metodes vai atraduši visu nukleotīdu secību, kas veido genomu. Lai sekvencētu augu genomu, zinātniekam ir jānosaka katrs nukleotīds, kas atrodams katrā pētāmā auga hromosomā.

Augu genomu secību noteikšana nav bijusi vienkārša augu plašā klāsta, kā arī to genomu lielās atšķirības dēļ. Augu genoma izmēru diapazons atšķiras no sugām, kuru genomi ir tikpat mazi kā maziem dzīvniekiem, līdz citiem augiem, kuru genomi ir gandrīz četrdesmit reizes lielāki par cilvēka genomu. Pats pirmais augu genoms, kas tika pilnībā sekvencēts, bija Arabidopsis augs, kas ir mazs kressalātes augs, kas ir daļa no sinepju dzimtas. Šis augs tika izvēlēts, jo tam ir salīdzinoši īss genoms, salīdzinot ar citiem augiem. Arabidopsis genoma sekvencēšana atklāja, ka tajā ir 25,000 gēnu, kurus tagad izmanto, lai palīdzētu noteikt to augu genoma secību, kuriem ir daudz garāki un daudz sarežģītāki genomi.