Endokrīnie orgāni ir orgāni, kas izdala hormonus. Šie orgāni var būt vai nu vienīgi veltīti hormonu ražošanai un sekrēcijai, vai arī tos var veikt papildus citām funkcijām. Endokrīnie orgāni, kas ir veltīti tikai endokrīnām funkcijām, ir hipofīze, vairogdziedzeris un epitēlijķermenīšu dziedzeri. Arī čiekurveidīgs dziedzeris un virsnieru dziedzeri ir paredzēti tikai hormonu ražošanai un sekrēcijai. Aizkuņģa dziedzeris, aizkrūts dziedzeris, dzimumdziedzeri un hipotalāms ir endokrīnās sistēmas orgāni, kas kopā ar citām funkcijām nodrošina endokrīnās funkcijas.
Lai šie hormoni nonāktu asinīs un limfātiskajās sistēmās, endokrīnos orgānus parasti ieskauj asins un limfas asinsvadi. Tos sauc par endokrīnajiem orgāniem, jo tie izdala hormonus apkārtējos šķidrumos, nevis izdala tos caur kanāliem uz citu virsmu vai orgānu, kā to dara eksokrīnie orgāni. Šūnas, kas izdala hormonus, bieži ir izkārtotas līnijā vai sazarojumā, lai palielinātu iedarbību. Hormoni tiek izdalīti apkārtējā šķidrumā un pēc tam tiek nosūtīti pa asinīm un limfas asinsvadiem.
Daži endokrīnie orgāni atrodas smadzenēs vai ap tām. Piemēram, hipotalāms kontrolē daudzu citu endokrīno hormonu izdalīšanos. Tas atrodas diencefalona, smadzeņu daļas, apakšējā daļā. Hipotalāms regulē endokrīno sistēmu, mainot hormonus, ko izdala hipofīze, endokrīnais orgāns, kas atrodas tieši zem smadzenēm. Daudziem no šiem kontrolējošajiem hormoniem, kas izdalīti no hipofīzes, ir pāri — atbrīvojošais hormons un inhibējošais hormons.
Čiekurveida dziedzeris atrodas diencephalona augšdaļā. Tās hormons, melatonīns, palīdz regulēt diennakts ritmus. Diennakts ritms ir dabiskais nomoda un miega ritms, kas ļauj cilvēkam palikt nomodā dienas laikā un gulēt naktī.
Vairogdziedzeris ir lielākais endokrīnais orgāns, kas ir veltīts tikai endokrīnām funkcijām. Šis orgāns izdala vairogdziedzera hormonus, kas izraisa bazālo vielmaiņas ātrumu. Parathormona dziedzeri atrodas aiz vairogdziedzera. Lielākajai daļai cilvēku ir četri no šiem endokrīnās sistēmas orgāniem, bet citiem var būt vairāk vai mazāk. Parathormons izdala hormonus, kas regulē kalcija līmeni asinīs.
Virs nierēm atrodas virsnieru dziedzeri. Tie faktiski ir divi dziedzeri: virsnieru medulla un virsnieru garoza. Abi šie dziedzeri palīdz cilvēkiem tikt galā ar dažādiem stresa veidiem. Virsnieru medulla izdala hormonus, kas palīdz cilvēkam izbēgt vai bēgt no briesmām. Virsnieru garoza izdala steroīdus hormonus, piemēram, aldosteronu, hormonu, kas palīdz kontrolēt asins tilpumu.
Dzimumdziedzeri ir endokrīnās sistēmas orgāni, kas izdala cilvēka reprodukcijai nepieciešamos dzimumhormonus. Vīriešiem šie orgāni ir sēklinieki. Šie orgāni izdala hormonu testosteronu, kā arī citus hormonus. Sievietēm dzimumdziedzeri ir olnīcas. Olnīcas izdala dažādus hormonus, piemēram, estrogēnus un progesteronus.
Kakla lejasdaļā atrodas aizkrūts dziedzeris, endokrīnais orgāns, kas atbrīvo aizkrūts dziedzera hormonus. Šie hormoni palīdz T limfocītiem, ko sauc arī par T-šūnām, attīstīties no limfocītu prekursoru šūnām. Visbeidzot, aizkuņģa dziedzeris ir endokrīnais orgāns, kas atrodas vēdera dobumā. Tas izdala vairākus hormonus, tostarp insulīnu un gulkagonu. Gan insulīns, gan glikagons palīdz regulēt cukura līmeni asinīs; insulīns samazina cukura līmeni asinīs, kad tas kļūst pārāk augsts, un glikagons to palielina, kad tas kļūst pārāk zems.