Fagocitoze ir process, ko šūnas izmanto, lai absorbētu un pēc tam uzņemtu barības vielu vai baktēriju daļiņas. Šis process ir ļoti svarīga šūnu darbības sastāvdaļa, ļaujot šūnām satvert vitāli svarīgas barības vielas un ļaujot organismam pasargāt sevi no kaitīgām baktērijām. Šūnu, kas specializējas šajā procesā, sauc par fagocītiem. Tas ir viens no procesu saimes, ko kopīgi apzīmē ar vispārēju terminu “endocitoze”, kas attiecas uz jebkāda veida materiāla uzņemšanu šūnā. Pretējs ir eksocitoze, nevēlama materiāla izvadīšana no šūnas.
Šajā procesā šūna deformē savu membrānu, veidojot nelielu konusu ap absorbējamo materiāla gabalu, un pēc tam tā aizver konusa malas, apskaujot daļiņu šūnas membrānā, lai izveidotu tā saukto fagosomu. vai pārtikas vakuola, piemēram, neliels materiāla apvalks, ko ieskauj šūnu membrāna. Savukārt fagosoma tiek nodota šūnā absorbcijai lizosomās, šūnu struktūrās, kas specializējas šūnā ienākošo materiālu sagremošanā. Lizosomas sadala fagosomu tā sastāvdaļās, nododot derīgos savienojumus uz citām šūnas struktūrām un izvadot pārējo kā atkritumu materiālu. Dažu infekciozu vai kaitīgu materiālu gadījumā fagosoma var iekļūt peroksisomā, īpašā šūnu struktūrā, kas palīdz atbrīvot ķermeni no toksīniem.
Vienšūnu organismos fagocitoze ir kritiska funkcija, jo bez tās organisms neizdzīvos. Daži no šiem organismiem ir pielāgojuši īpašas iezīmes, kas ļauj tiem izsekot barībai, orientējoties noderīgo daļiņu virzienā, ko tie var uzņemt. Daudzšūnu organismos tas mēdz būt pasīvāks process, taču tas joprojām ir ļoti svarīgs atsevišķu šūnu izdzīvošanai, nodrošinot, ka tās saņem funkcionēšanai nepieciešamās barības vielas.
Imūnsistēmas šūnas veic arī fagocitozi, aizturot kaitīgos materiālus, kad tie nonāk organismā, un iznīcinot tos, lai tie nevarētu radīt bojājumus. Dažos gadījumos ķermenis var reaģēt ar iekaisumu, jo imūnsistēmas šūnu plūdi steidzas uz vietu, lai tiktu galā ar nevēlamiem iebrucējiem. Ja imūnsistēma vairs nespēj tikt galā ar kaitīgiem materiāliem vai ja šie materiāli pretojas norīšanas procesam, sekas saimniekorganismam var būt diezgan nepatīkamas.