Raph kodoli ir smadzeņu stumbra neironu kopums. Viņi ir atbildīgi par serotonīna izdalīšanos citās smadzeņu daļās un ka serotonīns ir iesaistīts virknē fizioloģisko un patoloģisko funkciju cilvēka organismā. Smadzeņu stumbrā ir vairāki dažādi kodoli, kas regulē serotonīna izdalīšanos, kas kontrolē miega modeļus, garastāvokli, sāpju reakciju un motoriskās funkcijas.
“Raphe” attiecas uz ķermeņa šuvi vai izciļņu, kur kreisā un labā struktūra savienojas kopā. Šī smadzeņu daļa ir apzīmēta ar terminu, jo tā atrodas abu smadzeņu stumbra pušu krustpunktā. Tā ir arī vieta, kur saplūst citas smadzeņu daļas, piemēram, iegarenās smadzenes.
Visas šīs sastāvdaļas, katra tikai milimetru garumā, atrodas smadzeņu daļās zem smadzeņu daivām, kur notiek augstākās funkcijas. Smadzenes ir lielākā cilvēka smadzeņu daļa. Tas ietver priekšējo daivu, kas kontrolē problēmu risināšanu un citas kognitīvās funkcijas; pakauša daiva; un parietālās un temporālās daivas.
Raph kodolos šūnu blīvums ievērojami atšķiras dažādos reģionos, kas nozīmē, ka neironu skaits noteiktā telpā atšķiras no vienas vietas uz otru. Šīs struktūras ietver dorsālo raphe kodolu, kurā ir vairāk serotonīnu ražojošu jeb serotonīnerģisku neironu nekā jebkur citur cilvēka smadzeņu stumbrā. Tas ir arī lielākais no raphe kodoliem. Otrais pēc izmēra ir raphe obscurus.
Astes lineārajā kodolā ir arī daudzas serotonīnerģiskas smadzeņu šūnas. Citas raphe kodolu sastāvdaļas ir vidējais raphe kodols; raphe magnus kodols, medulla malā; un raphe pallidus kodols. Pēdējais ir ķekara mazākais raphe kodols.
Ja tas viss šķiet sarežģīti, tas tiešām ir. Pat zinātnieki, kas specializējas cilvēka smadzenēs, pilnībā nesaprot, ko dara katrs no raphe kodoliem. Kodoliem ir izvirzījumi – daži, kas ved uz centrālajām smadzenēm, un citi, kas ved uz muguras smadzenēm, kas kalpo kā serotonīna ceļi. Piemēram, muguras raphe projicē smadzeņu garozā, amygdalā un melnā krāsā. Projekcijas ir kopīgas smadzeņu stumbra struktūru iezīmes, tostarp locus coeruleus, kas ir saistīta ar depresiju un miegu.
Ir zināms, ka serotonīns tiek ražots arī smadzenēs, tāpēc ir grūtāk analizēt katra raphe kodola un citu smadzeņu daļu mijiedarbību. Lai gan serotonīna loma smadzeņu attīstībā un pamatfunkcijās ir zināma, tā ražošana joprojām nav pilnībā izprotama. Rafa kodolu struktūras ir rūpīgi analizētas cilvēka neiroanatomijā, taču to sarežģītība joprojām atstāj dažus noslēpumus zinātnes pasaulei.