Saikne starp kafiju un kuņģa darbības traucējumiem var būt saistīta ar kofeīnu un grēmām. Kafijā esošais kofeīns var stimulēt kuņģa skābju veidošanos, izraisot grēmas. Grēmas var izraisīt kuņģa darbības traucējumus. Kofeīns ir stimulants, kas palielina sirdsdarbības ātrumu, ko var tieši saistīt ar sliktu dūšu.
Kafija ir pieejama kofeīna, puskofeīna un bezkofeīna formās. Kafijā bez kofeīna ir mazāk kofeīna nekā citos veidos, bet divi līdz četri miligrami (mg) kofeīna paliek pat pēc apstrādes, lai noņemtu kofeīnu. Kafijā ar pusi kofeīna parasti ir aptuveni 50–60 mg, bet kofeīna saturošā kafijā ir aptuveni 100–120 mg.
Jutība pret perorālajiem stimulatoriem ir viens no izplatītākajiem kafijas un kuņģa darbības traucējumu cēloņiem. Kafijā esošais kofeīns var izraisīt sirdsdarbības ātruma palielināšanos, izraisot sliktu dūšu, reiboni un aizkaitināmību. Kafijas dzeršana ar mazāku kofeīna saturu var palīdzēt samazināt blakusparādību. Kafijas aizstāšana ar tēju var vēl vairāk samazināt kofeīna uzņemšanu un ar to saistītās kuņģa problēmas.
Cilvēki, kuri nav jutīgi pret kofeīnu, var arī ciest no kafijas un kuņģa darbības traucējumiem. Kofeīna pārdozēšana notiek, ja īsā laikā tiek patērēts pārāk daudz kofeīna. Kofeīna pārdozēšana, ko bieži dēvē par kafijas nervozitāti, parasti nav dzīvībai bīstama, taču var paiet stundas, līdz stimulācija un slikta dūša pāriet.
Kafija arī izraisa kuņģa skābju veidošanos, kas var izraisīt kuņģa darbības traucējumus. Kuņģa skābes parasti rodas, ēdot pārtiku, lai sāktu gremošanas procesu. Ja kuņģī nav pārtikas, skābes var izraisīt kairinājumu un kuņģa darbības traucējumus. Tāpēc ēdiena ēšana, dzerot tasi kafijas, var novērst nelabuma sajūtu.
Daži kafijas zīmoli vai stili ir skābāki nekā citi. Šķirnes ar zemu skābumu var nestimulēt tik daudz kuņģa skābes izdalīšanos. Brūvējot ar karstu ūdeni, kafija var būt skābāka. Aukstā brūvēšana ir dzīvotspējīga alternatīva, taču tā parasti aizņem ilgāku laiku nekā karstā alus pagatavošana. Auksta ūdens izmantošana kafijas pagatavošanai ietver kafijas biezumu mērcēšanu aukstā ūdenī trīs līdz četras stundas vai visu nakti, pirms tie tiek izkāsta no dzēriena.
Alerģija pret kafiju var būt vēl viens saiknes avots starp kafiju un kuņģa darbības traucējumiem. Kafija satur tanīnus. Mēreni tanīna alerģijas simptomi ir kuņģa darbības traucējumi. Augšanas fāzē izmantotie pesticīdi un herbicīdi ir saistīti arī ar alerģiskām reakcijām.
Ja problēma ir kafija un kuņģa darbības traucējumi, ir pieejamas alternatīvas tradicionālajai kafijai. Tēja un sojas kafija ir divas, kas ir plaši pieejamas daudzos pārtikas preču tirgos visā pasaulē. Pirms pilnībā izlaist kafiju, var izslēgt citus kuņģa darbības traucējumu cēloņus, piemēram, jutīgumu pret piena produktiem vai kofeīnu.