Kafijā esošā kofeīna daudzums patiesībā ir ļoti mainīgs, atkarībā no vairākiem faktoriem, tostarp no katra auga, no kura pupiņas tiek novāktas, kā pupiņas tiek apstrādātas un kafija tiek pagatavota. Viena parastās kafijas tase var saturēt no 65 līdz 175 miligramiem kofeīna. Koncentrētāka kafija, piemēram, espresso, var saturēt aptuveni 50 miligramus vienā porcijā, savukārt kafija bez kofeīna satur aptuveni 2 līdz 4 miligramus vienā porcijā.
Pirmais mainīgais, kas nosaka, cik daudz kofeīna ir kafijā, ir auga veids, no kura nāk pupiņas. Coffea arabica augs, ko dod priekšroku kafijas ražošanai, jo pupiņām mēdz būt izcila garša, satur mazāk kofeīna nekā C. robusta augā. Dažreiz ražotāji gatavo maisījumus ar abu sugu pupiņām, lai līdzsvarotu garšu ar vēlmi pēc vairāk kofeīna. Atsevišķi kafijas augi arī ražo dažādus kofeīna līmeņus atkarībā no šķirnes, kur tā tiek audzēta un kā tā tiek apstrādāta augšanas periodā.
Kad kafijas pupiņas tiek novāktas, tajās jau ir ļoti atšķirīgs kofeīna līmenis ne tikai no augiem uz augiem, bet dažreiz arī uz viena auga. Kafijā esošā kofeīna daudzumu nosaka arī tas, kā pupiņas tiek uzglabātas, apstrādātas un apstrādātas. Papildus skaidrai kofeīna samazināšanai ar ķīmisku apstrādi pupiņas var tikt pakļautas arī karstumam, mitrumam un citiem apstākļiem, kas visi ietekmē kofeīna saturu.
Neatkarīgi no tā, vai patērētāji strādā ar maltu kafiju vai veselām pupiņām, ko viņi sasmalcina paši, kafijas pagatavošanas veids ietekmē katrā tasītē esošā kofeīna daudzumu. Lietojot vairāk biezumu, palielināsies kofeīna līmenis, kā arī mainīsies karstuma daudzums un spiediens, kam pupiņas tiek pakļautas. Piemēram, espresso ir augsts kofeīna saturs, jo tie ir izgatavoti no cieši iesaiņotām pupiņām, kas pakļautas augstam karstumam un spiedienam, tādējādi nodrošinot lielāku kofeīna ekstrakciju nekā ar pilienu vai pagatavotu kafiju.
Ir veikti daži pētījumi par vidējo kofeīna saturu, kas atrodams populārās kafijas šķirnēs. Tomēr daudzi no šiem pētījumiem nav īpaši noderīgi patērētājiem, kuri interesējas par kofeīna patēriņu, jo ir iesaistīts pārāk daudz mainīgo lielumu, sākot no pupiņu novākšanas gada līdz tam, kā pētnieki ar tām rīkojās, veicot testus. Cilvēki, kuri meklē vairāk kofeīna, iespējams, vēlēsies meklēt pilienveida kafiju un espresso. Šķīstošā kafija parasti satur mazāk kofeīna.