Mezoderma ir viens no trim galvenajiem slāņiem jaunattīstības embrijā, ko dēvē par dzimumšūnu slāņiem. Citi dzimumšūnu slāņi ir endoderma un ektoderma. Kad embrijs attīstās, no šiem dzimumšūnu slāņiem attīstās dažādi orgāni un ķermeņa daļas. No mezodermas attīstās muskuļi, kauli, daži ādas audi, saistaudi, reproduktīvās un urīnceļu sistēmas un citi iekšējie orgāni. Visu sarežģīto dzīvnieku, tostarp cilvēku, embriji to agrīnajā attīstībā satur mezodermālos slāņus.
Tas, kā mezoderma funkcionē embrija attīstībā, raksturo sarežģīto procesu, kurā cilvēki un citi mugurkaulnieki attīstās dzemdē. Katrs no dažādajiem agrīnā embrija slāņiem sākas kā salīdzinoši vienkāršas struktūras, pēc tam mainās un aug, veidojot daudzas mijiedarbīgas daļas, kas nepieciešamas funkcionējošas dzīvas būtnes izveidošanai. Katrs slānis kļūst par orgāniem un audiem, kas ir atkarīgi no audiem un orgāniem, kas izveidoti citos slāņos, tāpēc katram slānim ir jānotiek pareizi, lai attīstītos dzīvotspējīgs auglis.
Pašā mezodermā ir papildu slāņi, kas grūtniecības laikā diferencējas dažādos orgānos un ķermeņa daļās. Katra no šīm apakšnodaļām attīstās par atšķirīgu orgānu un citu ķermeņa audu kopumu. Pārējie divi slāņi, ektoderma un endoderma, galu galā kļūst par ārējiem audiem, piemēram, ādu un zobiem (ektoderma) un iekšējiem audiem, kas izklāj lielāko daļu iekšējo orgānu (endoderma). Šis attīstības process ir līdzīgs lielākajai daļai mugurkaulnieku.
Viens no mezodermas slāņiem ir sānu plātņu mezoderma. Šī embrionālo audu daļa sadalās slāņos, kas attīstās ķermeņa sieniņās, kā arī zarnu sieniņās un asinsrites sistēmā. Vēl viens slānis, starpposma mezoderma, kļūst par urīnceļu un reproduktīvo sistēmu. Paraksiālā mezoderma kļūst par sejas muskuļiem, skriemeļiem, skeleta muskuļiem un ādas dermas slāni. Chordamesoderma jeb aksiālā mezoderma attīstās dažādās mugurkaula daļās.
Vēl viens šī attīstības līdzekļa ieguvums ir tas, ka procesa sākumā veidojas coelom jeb ķermeņa dobums. Šajā dobumā ir vieta dažādu iekšējo orgānu attīstībai. Kad dzīvnieks ir nobriedis, ķermeņa dobumā, kas atrodas vēderā, atrodas lielākā daļa dzīvībai svarīgo orgānu, nodrošinot aizsardzību tādām delikātām un svarīgām ķermeņa daļām kā sirds, plaušas un zarnas. Vēdera dobuma odere, ko sauc par vēderplēvi, arī ir iegūta no mezodermas agrīnās attīstības laikā.