Tiroksīna blakusparādības parasti ir reti, bet var būt nopietnas. Tiroksīns ir hormonu aizstājterapija, ko organisms parasti labi panes, un, ja rodas blakusparādības, tas parasti ir pārāk lielas devas dēļ. Pirmoreiz lietojot zāles, var rasties matu izkrišana, bet parasti tas ir īslaicīgs. Retāk sastopamas, bet nopietnas blakusparādības, kas var rasties, ir pastiprināta svīšana, garastāvokļa izmaiņas, trīce un miega traucējumi. Ļoti retos gadījumos pacientam var rasties sāpes krūtīs, neregulāra sirdsdarbība, krampji vai, iespējams, alerģiska reakcija.
Parasti lielākajai daļai cilvēku, lietojot tiroksīnu, pat grūtniecības laikā būs maz blakusparādību vai tās vispār neradīs. Dažiem cilvēkiem pirmajos zāļu lietošanas mēnešos būs matu izkrišana, taču tas parasti izzūd, tiklīdz ķermenim ir bijusi iespēja pielāgoties. Turklāt sievietes, kas lieto šīs zāles, var atklāt, ka viņām ir neregulāri menstruālie cikli.
Ja organismā ir pārāk daudz vairogdziedzera hormonu no tiroksīna pārdozēšanas, tas var izraisīt hipertireozi. Dažas no retāk sastopamajām blakusparādībām ir pastiprināta svīšana, jutība pret karstumu, caureja un trīce. Tas var izraisīt arī garastāvokļa izmaiņas, piemēram, nervozitāti, trauksmi un aizkaitināmību. Turklāt tas var izraisīt galvassāpes, elpas trūkumu, muskuļu krampjus vai vājumu un miega traucējumus. Citas blakusparādības var būt neparasts svara zudums vai pieaugums, ēstgribas izmaiņas un vemšana.
Ļoti retos gadījumos tiroksīna blakusparādības var būt smagas. Sāpes krūtīs, sirdsklauves vai neregulāra sirdsdarbība, krampji un roku, potīšu un pēdu pietūkums norāda uz smagu reakciju. Ja pacientam ir alerģiska reakcija pret tiroksīnu, viņam var rasties izsitumi vai pietvīkums, izteikts reibonis un apgrūtināta elpošana. Personai var būt arī nieze un pietūkums, īpaši sejas, mēles vai rīkles. Pārdozēšanas vai alerģiskas reakcijas gadījumā pacientam nekavējoties jāmeklē medicīniskā palīdzība.
Ja tiroksīna deva ir pārāk zema, tas var izraisīt blakusparādības, ko izraisa nepietiekams vairogdziedzera līmenis, ko sauc arī par hipotireozi. Tie ir nogurums, muskuļu sāpes, sausa āda, svara pieaugums un jutība pret aukstumu. Medicīnas speciālists parasti palielina tiroksīna devu, lai ārstētu stāvokli.
Tiroksīnu lieto, lai paaugstinātu vairogdziedzera hormonu līmeni cilvēkiem ar pavājinātu vairogdziedzera darbību. Pietiekams vairogdziedzera hormonu līmenis ir nepieciešams garīgai un fiziskai aktivitātei, kā arī efektīvas vielmaiņas uzturēšanai. Var paiet četras nedēļas vai vairāk, līdz organisms saņems visas zāļu priekšrocības un pielāgojas zāļu īslaicīgajām blakusparādībām.