Pacientiem, kuriem nepieciešama epitēlijķermenīšu operācija, lai noņemtu daļu no viena vai vairāku epitēlijķermenīšu dziedzeru, ir vairākas iespējas. Tradicionālo ķirurģisko iespēju, kas tiek izmantota kopš 1925. gada, sauc par paratiroidektomiju; tas nozīmē, ka ķirurgs atver iegriezumus kaklā, novērtē, kurš dziedzeris vai dziedzeri nedarbojas, un izņem nepieciešamos audus. Jaunāka metode, minimāli invazīva radiovadīta paratiroidektomija jeb MIRP, ietver audu atrašanās vietu, kas ir jānoņem pirms griezuma. Visbeidzot, dažiem pacientiem var būt iespēja veikt endoskopisku paratiroidektomiju, kas ir arī mazāk invazīva metode nekā tradicionālā ķirurģija un var samazināt rētu veidošanos.
Visilgāk izmantotā epitēlijķermenīšu operācijas veids ir standarta paratireoīdektomija. Šīs procedūras veikšanai ķirurgam ir jāatver iegriezumi abās kakla pusēs, parasti aptuveni 5 līdz 10 collu (12 līdz 25 cm) garumā, kas atklāj četrus epitēlijķermenīšu dziedzerus. Pēc tam viņš vai viņa nosaka, kurš dziedzeris vai dažos gadījumos dziedzeri ir palielināts un tāpēc nedarbojas pareizi, un noņem to. Šai procedūrai pacientam tiek veikta vispārējā anestēzija, un viņš parasti pavadīs nakti slimnīcā. Lai gan tai ir diezgan augsts panākumu līmenis, tās panākumi ir ļoti atkarīgi no pieredzējuša ķirurga; tam ir arī trūkums, jo tas atstāj diezgan lielas rētas.
Vēl viena iespēja epitēlijķermenīšu ķirurģijā ir minimāli invazīva radiovadīta paratiroidektomija. MIRP ietver nelielas radioaktīvo zāļu devas izmantošanu, lai precīzi noteiktu patoloģiskos epitēlijķermenīšu audus, kurus pēc tam var noteikt, izmantojot īpašu zondi. Ķirurgs, kurš precīzi zina, kurš dziedzeris ir jānoņem, atvērs nelielu iegriezumu kakla pusē, kur atrodas dziedzeris, un noņems to. Šī procedūra parasti ir pat veiksmīgāka nekā tradicionālā operācija un rada mazāk komplikāciju. To var izdarīt arī, izmantojot vietējo anestēziju, tam ir īsāks, mazāk sāpīgs atveseļošanās laiks, un tam ir nepieciešams daudz mazāks iegriezums aptuveni collas (2.5 cm) apmērā.
Endoskopiskā paratiroidektomija ir vēl viena iespēja pacientiem, kuriem nepieciešama epitēlijķermenīšu operācija. Tiek veikts iegriezums, kurā tiek ievietots endoskops, kurā ir apgaismojums un kamera, lai atrastu aizskarošo dziedzeri. Pēc tam tiek ievietoti speciāli instrumenti, lai noņemtu bojātos audus. Šī operācija ir arī mazāk invazīva nekā standarta procedūra, atstājot ļoti mazu rētu mazāk redzamā vietā nekā uz kakla, kā arī atveseļošanās laiks ir īsāks un mazāk sāpīgs.