Parasti mērce satur kviešu miltus. Vienkāršākais veids, kā pagatavot bezglutēna mērci, ir izmantot miltu aizstājēju, kas nesatur lipekli. Pavāriem ir vairākas iespējas bezglutēna miltu aizstājējiem, sākot no rīsu miltiem līdz kukurūzas cietei. Daži krājumi vai buljoni var saturēt lipekli, tāpēc pavāram, gatavojot bezglutēna mērci, rūpīgi jāpārbauda sastāvdaļas.
Glutēns slēpjas vairākās vietās, tāpēc pavāram, kurš vēlas pagatavot bezglutēna mērci, jābūt īpaši uzmanīgam. Vislabāk ir izvairīties no mērces maisījumiem, jo daudzi no tiem satur lipekli. Dažos sagatavotos vistas vai dārzeņu buljonos var būt arī lipeklis, tāpēc pavārei labāk ir gatavot savu buljonu no jauna, ja viņa nevar atrast sertificētu buljonu, kas nesatur lipekli. Ja tiek gatavota gaļas mērce, viņa var izmantot pannas pilienus, ja gaļai nav pagatavotas kviešus vai glutēnu saturošas sastāvdaļas.
Lai pagatavotu bezglutēna mērci, ir divas metodes. Pirmajā metodē pavārs var izmantot glutēnu nesaturošu miltu aizstājēju kviešu miltu vietā, lai pagatavotu roux. Lai to izdarītu, viņam katliņā vajadzētu izkausēt margarīnu vai sviestu un pievienot tādu pašu daudzumu bezglutēna miltu. Labi derēs aunazirņu vai rīsu milti. Viņš var arī izmantot eļļu, piemēram, rapšu vai olīveļļu, nevis margarīnu vai sviestu.
Miltus un taukus saputo kopā uz vidēji zemas uguns, līdz tie kļūst nedaudz tumši brūni. Gatavošanas laikā pavāram ir jāseko līdzi, jo glutēnu nesaturošie milti var pagatavoties ātrāk nekā no kviešu gatavoti roux. Pēc tam, kad rozs ir pagatavots, pavāram jāielej buljona vai pannas pilieni, saputot, lai rozs sadalītos un atbrīvotos no gabaliņiem. Viņa var pievienot mērcei jebkuras bezglutēnu garšvielas, ko viņa vēlas.
Vēl viena vienkārša metode bezglutēna mērces pagatavošanai ir lēni izšķīdināt kukurūzas cieti vai citu bezglutēnu cieti, piemēram, bultu sakņu pulveri, uzsildītā buljonā vai pannas pilienos. Lai novērstu jebkādus kunkuļus, pavāram jāsajauc ciete ar nelielu ūdens daudzumu, lai izveidotu pastu vai vircu, pirms ielej karstā buljonā vai pilienos. Ja buljons ir vēss, viņa var pievienot cieti tieši tam.
Ja buljonam pievienojot cieti vai glutēnu nesaturošus miltus, tie nešķīst pareizi un mērce būs kunkuļaina. Parasti bezglutēna mērcei ir nepieciešams ilgāks laiks, lai sabiezētos nekā parastajai mērcei. Pavārs var gaidīt apmēram 20 minūtes, līdz mērce pilnībā sabiezē.