Visbiežākais rīta flegma cēlonis ir postnazāla pilēšana, kas rodas, kad liekās gļotas noplūst līdz rīklei vai deguna aizmugurē. Pilienu pēc deguna var izraisīt daudzi faktori, sākot no neliela līdz nopietnam. Nelieli postnazālas pilēšanas cēloņi ir alerģiska reakcija, kairinājums no apkārtējā vidē esošiem materiāliem vai nealerģisks, neinfekciozs rinīts. Smagāk, pēc deguna pilēšana var izraisīt rīta flegmu hroniska sinusīta, astmas un hroniskas obstruktīvas plaušu slimības (HOPS) gadījumos. Lai gan dekongestanti, deguna aerosoli un deguna skalošanas līdzekļi var palīdzēt mazināt nelielus flegma cēloņus, nopietnākos stāvokļos parasti nepieciešama ārsta aprūpe.
Gaisā esošās vielas indivīda miega vidē var izraisīt alerģisku reakciju vai kairinājumu. Jāņem vērā indivīda personīgās alerģijas un jāizpēta apkārtējā vide, lai noteiktu iespējamos kairinātājus. Gulēšana ar atvērtu muti var arī palielināt iespējamību, ka ieelpos un veidos netīrumus deguna ejās.
Nealerģisks, neinfekciozs rinīts ir definēts kā deguna iekšējo elpceļu iekaisums, ko nav izraisījis alergēns vai vīrusu vai baktēriju infekcija. Vairumā gadījumu šāda veida rinīts paliek pēc saaukstēšanās vai sinusīta. Tas parasti ir labdabīgs un parasti pāriet atsevišķi.
Sinusīts pats par sevi tiek definēts kā deguna blakusdobumu iekaisums, ko parasti izraisa alerģija vai vīrusu infekcija. Retos gadījumos baktēriju augšana jau iekaisušajā un ar gļotām piepildītā deguna ejā var izraisīt bakteriālu infekciju, un visas iepriekš minētās situācijas var izraisīt rīta flegmu. Hronisks sinusīts ir sinusīta gadījums, kas ilgst vairāk nekā astoņas nedēļas. Tas parasti ir nopietnāks, un tam ir nepieciešama plaša medicīniskā pārbaude, lai iegūtu pārliecinošu diagnozi par cēloni.
Astmu raksturo hronisks elpceļu iekaisums, un to var izraisīt dažādi vides un ģenētiski faktori. Bieži vien cilvēki ar astmu ir jutīgāki pret vides kairinātājiem, tostarp aukstu gaisu. Tas var ne tikai ierobežot elpceļus, bet arī izraisīt pārmērīgu gļotu veidošanos. Dažas personas, kas cieš no astmas, var būt īpaši pakļautas tam nakts laikā, padarot viņus noslieces uz rīta flegmu.
HOPS ir plaušu slimība, kas ietver bronhītu un emfizēmu, divus stāvokļus, kas bieži tiek novēroti blakus. Abas slimības mēdz izraisīt elpceļu sašaurināšanos plaušās, kā arī ievērojamu gļotu veidošanās pieaugumu, kas abām slimībām mēdz saasināt otru. Šos stāvokļus parasti novēro smēķētājiem, un to kontrolei bieži nepieciešama plaša medicīniska palīdzība.
Deguna skalošana var palīdzēt izvadīt no deguna krēpas un gružus, nodrošinot vismaz īslaicīgu atvieglojumu, ja pēcnazālo pilēšanu izraisa viela, kas izplatās miega vidē. Ja pilienu izraisa iekaisums, dekongestants vai deguna steroīdu aerosols var sniegt atvieglojumu, bet parasti tas ir jālieto regulāri. Rīta flegma, kas liecina par nopietnāku veselības stāvokli, parasti prasa ārsta uzmanību, lai to pareizi ārstētu.