Mikotoksīni ir toksiskas vielas, ko ražo sēnītes, parasti kā sekundāri vielmaiņas produkti. Šie toksīni ļoti interesē cilvēkus, jo tie cilvēkiem var izraisīt slimības vai pat nāvi, taču tos var arī izmantot dažādi. Piemēram, dažas Penicillium sēnītes ražo mikotoksīnus, kas ir kaitīgi baktērijām. Mikotoksīnu izpēte laboratorijā ir progresējusi lēcieniem un robežām kopš 20. gadsimta vidus, kad cilvēki sāka apzināties mikotoksīnu izplatību vidē.
Toksīnu veidošanās dabā nav nekas neparasts. Daudzi organismi ražo toksīnus, lai padarītu sevi mazāk pievilcīgus, nodrošinot, ka tie dzīvos, lai nodotu savu ģenētisko materiālu, nevis tiktu ēst. Citos gadījumos toksīns ir tīri nejaušs organisma metabolisma blakusprodukts. Sēnes nejauši rada dažus toksīnus aminoskābju veidošanās procesā, ko tās izmanto, lai sagremotu apēstos materiālus. Nedaudz neparasti sēnītes sagremo lietas pirms ēšanas, izdalot aminoskābes uz organiskām vielām, lai tās sadalītos, pirms tās patērē.
Indīgās sēnes ir slavenas cilvēku vidū ar to mikotoksīniem. Liels skaits sēņu satur savienojumus, kas izraisa kuņģa-zarnu trakta traucējumus, bet dažām ir bīstamāki toksīni, piemēram, alfa-amanitīns, mikotoksīns, kas atrodas dažās Amanita sēnēs. Dažas sēnes satur mikotoksīnu kokteili, kas garantēti izraisīs vismaz zināmu zarnu rībošanos, ja ne nopietnākus simptomus.
Apziņa par pelējuma radītajiem mikotoksīniem ir pieaugusi arī kopš 1980. gadiem, kad cilvēki pirmo reizi sāka apzināties bīstamo pelējuma sēnīšu risku. Dažas pelējuma sēnītes, kas inficē sienas, paklājus un tā tālāk, rada mikotoksīnus, kas var būt bīstami, pieskaroties, ieelpojot vai patērējot. Cilvēki, kuri ir saslimuši no pelējuma iedarbības, dažos gadījumos ir veiksmīgi iesūdzējuši tiesā par zaudējumu atlīdzināšanu, apgalvojot, ka konstrukcijas ražotājs vai īpašnieks nav to pareizi uzbūvējis un uzturējis, aicinot pelējuma invāziju.
Sēnīšu radītie toksīni bija zināmi arī senajā pasaulē. Ergot, sēne, kas invadē labības graudus, slaveni ražo toksīnu, kas izraisa dažādus krāsainus simptomus. Daži cilvēki vēsturiski ir apzināti lietojuši melno graudu, lai izbaudītu tā psihotropo iedarbību, un mūsdienās šī paša iemesla dēļ tiek patērētas dažas citas sēnītes.
Mikotoksīnu iedarbības simptomi ievērojami atšķiras, jo tie ir tik dažādi. Arī mikotoksīnu ietekme var atšķirties atkarībā no iedarbības daudzuma un ilguma. Daudzi mikotoksīni ietekmē nervu sistēmu, izraisot tādus simptomus kā reibonis, neveiklība, neskaidra redze un apjukums, taču šie simptomi neparādās visos gadījumos vai ar visiem mikotoksīniem.