Micēlijs ir sēnes veģetatīvā daļa, kas nozīmē, ka tā ir daļa, kas izplatās ar aseksuālu reprodukciju. Tas sastāv no hifu tīkla, zarojošiem vai dakšveida pavedieniem līdzīgām struktūrām. Atkarībā no sēnītes veida un tā, cik labi tā ir attīstīta, micēlijs var būt redzams vai mikroskopisks. Pelējums, kas aug, piemēram, uz bojājošas pārtikas, ir redzama forma.
Papildus aseksuālai reprodukcijai micēlijs ir atbildīgs par barības vielu uzsūkšanos no vides. Tas izdala fermentus apkārtējā vidē, lai sadalītu pārtikas avotu sagremojamā formā, pēc tam absorbē to. Šis process arī palīdz atmirušajam augu materiālam un citiem organiskiem materiāliem sadalīties. Materiāls var arī palīdzēt atjaunot augsni, izmantojot šo procesu, piemēram, sadalot piesārņotājus, piemēram, pesticīdus. Dažas micēlijas palīdz augiem efektīvāk absorbēt ūdeni un barības vielas, bet citi ir arī nozīmīgi barības avoti bezmugurkaulniekiem, kas dzīvo augsnē.
Micēlija var būt arī ārkārtīgi plaša. Viena bēdīgi slavena sēnīšu kolonija austrumu Oregonas mežā savulaik aptvēra 2,400 akrus (9.7 kvadrātkilometrus). Tas izauga līdz šādam izmēram aptuveni 2,200 gadu laikā un daudzas reizes nogalināja augu augšanu mežā, katru reizi radot dziļākus augsnes slāņus, kas varēja izturēt arvien lielāku koku augšanu.
Dažreiz micēliju izmanto lauksaimniecībā vai ainavu veidošanā. Papildus spējai papildināt barības vielas, daži sēņu veidi veido simbiotiskas attiecības, ko sauc par mikorizu, ar auga saknēm. Augs un sēne palīdz viens otram saņemt barības vielas, kuras viņi nevarēja iegūt paši. Micēlijas var izmantot arī kā organisko filtru augsnei vai ūdenim procesā, ko sauc par mikofiltrāciju, kurā micēlija paklājs pasargā no kaitīgām ķīmiskām vielām un mikroorganismiem. Tos dažreiz izmanto arī jaunas augsnes noturēšanai uz nebruģētiem ceļiem.
Daži sēņu veidi izmanto seksuālo vairošanos, kā arī aseksuālo reprodukciju. Sēnītes seksuāli vairojošā daļa rodas no micēlija un tiek saukta par sporokarpu vai augļķermeni. Daudzu dažādu sēņu veidu augļķermeņi ir pazīstami kā sēnes vai trifeles, lai gan ir arī daži citi veidi.