Kad pārtika tiek sagremota, tā no kuņģa nonāk tievajās zarnās, tad resnajā zarnā. Pa ceļam dažādas skābes un citas vielas mijiedarbojas ar pārtiku, lai to noārdītu un ļautu organismam uzņemt tās sniegtās uzturvielas. Gan aizkuņģa dziedzeris, gan aknas savienojas ar tievo zarnu divpadsmitpirkstu zarnā, pievienojot zarnām svarīgas vielas, piemēram, žulti, insulīnu un glikagonu. Punktu, kurā tie savienojas ar zarnām, kas atrodas pie galvenās divpadsmitpirkstu zarnas papillas pusceļā gar divpadsmitpirkstu zarnas otro pusi, sauc par Vatera ampulu.
Pazīstama arī kā hepatopankreātiskā ampula, Vatera ampula pārnēsā žulti no kopējā žultsvada, kā arī izdalījumi no aizkuņģa dziedzera caur aizkuņģa dziedzera kanālu tievajās zarnās. Vairāki sfinkteri nodrošina, ka izdalījumi tiek novirzīti uz pareizo vietu un neļauj tievās zarnas saturam izplūst atpakaļ caur ampulu. Gan žultsvadam, gan aizkuņģa dziedzera kanālam ir sfinkteri, lai kontrolētu šķidruma plūsmu. Cits sfinkteris, hepatopankreatiskais sfinkteris, kontrolē šķidruma kustību caur aknu aizkuņģa dziedzera ampulu. Šis sfinkteris ir pazīstams arī kā Oddi sfinkteris.
Viens no sekrētiem, kas neplūst vienmērīgi caur gremošanas sistēmu, var būt pankreatīts. Šī slimība var rasties, ja zīdaiņa ampula tiek bloķēta, piemēram, ar žultsakmeņiem. Kad Vatera ampula ir bloķēta, aizkuņģa dziedzera ražotās gremošanas sulas, kas ietver insulīnu un glikagonu, aktivizējas aizkuņģa dziedzerī, nevis divpadsmitpirkstu zarnā. Pēc tam aizkuņģa dziedzera šūnas kļūst kairinātas, izraisot iekaisumu. Pankreatīts attiecas uz aizkuņģa dziedzera iekaisumu, un to var izsekot arī dažādiem citiem cēloņiem. Simptomi var būt sāpes vēderā, slikta dūša un sāpes vēderā, kas izplatās muguras lejasdaļā.
Retos gadījumos vēzis var attīstīties aknu un aizkuņģa dziedzera ampulā ar simptomiem, tostarp dzelti un sāpēm. Tāpat kā lielākā daļa vēža, agrīna atklāšana palielina atveseļošanās iespēju. Gadā Amerikas Savienotajās Valstīs parasti tiek diagnosticēti mazāk nekā 2,000 gadījumu, un šis skaits veido tikai divas desmitdaļas no viena procenta no visiem diagnosticētajiem kuņģa-zarnu trakta ļaundabīgajiem audzējiem. Šāda veida vēzis vienlīdz bieži sastopams gan vīriešiem, gan sievietēm, un to ārstē, noņemot vēzi, kā arī daļu no skartās divpadsmitpirkstu zarnas. Vater ampulas vēzis bieži metastējas limfmezglos, un piecu gadu izdzīvošanas rādītājs ir tikai aptuveni 40 procenti.