Galvenā saikne starp kafiju un sliktu dūšu ir tāda, ka kafija kairina kuņģi un var izraisīt kuņģa darbības traucējumus, tostarp sliktu dūšu. Daži cilvēki ir jutīgāki pret šo efektu nekā citi, un pārtikas patēriņš pirms kafijas dzeršanas var ietekmēt ar vēderu saistītus simptomus. Kafija var arī paaugstināt asinsspiedienu un izraisīt reiboni, kas var izraisīt sliktu dūšu, ja to neārstē. Dažos gadījumos dzēriens var izraisīt arī grēmas un caureju.
Slikta dūša bieži ir saistīta ar kafijas patēriņu, jo kafija satur augstu kofeīna līmeni. Tas var izraisīt kuņģa kairinājumu, reiboni, sirdsklauves un paaugstinātu asinsspiedienu. Katra no šīm lietām atsevišķi dažiem cilvēkiem var izraisīt sliktu dūšu, un simptomi var pasliktināties, ja tie tiek kombinēti. Daži cilvēki labāk panes kafijas patēriņu nekā citi, un ir daudzi faktori, kas var pastiprināt vai mazināt kafijas iedarbību.
Dažiem cilvēkiem, dzerot kafiju tukšā dūšā, var rasties slikta dūša. Ja nav cita satura, kas buferētu dzēriena skābuma ietekmi, var rasties pastiprināti kuņģa darbības traucējumi. Šī iemesla dēļ daudzi cilvēki uzskata, ka ir laba ideja dzert kafiju tikai ēdienreizes laikā vai tieši pirms vai pēc ēšanas. Ēšana arī samazinās reiboņa vai reiboņa iespējamību un var palīdzēt novērst asinsspiediena problēmas.
Augstais kofeīna saturs kafijā var izraisīt arī dehidratāciju, kas ir galvenais sliktas dūšas riska faktors. Dzerot kafijas dzērienu, daži cilvēki uzskata, ka par katru izdzertās kafijas tasi palīdz glāze ūdens. Papildus tam, ka ūdens saglabā ķermeņa hidratāciju un samazina sliktas dūšas risku, ūdens var arī sniegt enerģiju, un papildu kafija var nebūt nepieciešama.
Brūvētības stiprumam var būt arī nozīme sliktas dūšas simptomā. Lai gan gaišāku un tumšāku cepešu entuziasti jau gadiem ilgi strīdējušies par to, kurš veids satur vairāk kofeīna, jaunākie atklājumi liecina, ka būtiskas atšķirības nav. Brūvējuma stiprums acīmredzot ir vairāk saistīts ar kafijas veidu un kafijas tilpumu. Piemēram, tā kā viegli grauzdētas kafijas pupiņas ir mazākas nekā tumšās grauzdētas kafijas pupiņas, gaiša grauzdēta kauss satur vairāk kafijas nekā tumšā grauzdēta kafijas pupiņas, tādējādi vairāk kofeīna. Abu veidu kofeīna saturu un stiprumu var samazināt, pievienojot vairāk ūdens un mazāk kafijas vai pievienojot pienu, lai to vēl vairāk atšķaidītu. Laba alternatīva ir arī kafijas bez kofeīna dzeršana.
Turklāt ir kafijas maisījumi, kas ir īpaši izgatavoti tiem, kam ir kuņģa problēmas. Tie ir izstrādāti tā, lai būtu maigāki gremošanas sistēmai un izraisītu mazāk sliktas dūšas un citu simptomu. Lielākajā daļā pārtikas preču veikalu tie ir pieejami, un dažādiem ražotājiem var būt savi maisījumi.