Sēņu marinēšanai ir dažādi veidi, tāpēc labākās sēņu marinādes izvēle būs atkarīga no tā, kam sēnes tiks izmantotas un kāda veida marināde ir vēlama. Divas metodes ietver klasiskās aukstās marinādes, kas ietver sēņu ievietošanu šķidrumā uz stundām, un karstās marinādes, kas vāra sēnes šķidrumā. Sēnēm, kuras gatavojas cept uz grila, var būt nepieciešama stiprāka marināde nekā ceptajām. Dažām sēnēm ir ļoti smalka garša, un tās uzreiz iegūs marinādes raksturu, savukārt citām sēnēm ir īpaša garša, kas jāņem vērā. No labākās sēņu marinādes sanāks maltīte, kurā sākotnējās marinādes garša ir integrēta ar sēnēm ne pārāk skarbā, ne pārāk smalkā veidā.
Ja sēnes gatavojas izmantot salātos vai kādā citā ēdienā bez termiskās apstrādes, tad laba sēņu marināde nedrīkst būt pārāk spēcīga. Tā vietā tai vajadzētu ļoti līdzināties salātu mērcei, jo to varētu ēst un nepārspēt ēdienu, ar kuru tā mērcē. Izmantojot marinādi, kas paredzēta lietošanai uz vārītām sēnēm, kā marinādi termiski neapstrādātām sēnēm, tiks izveidots pārāk stiprs ēdiens ar neattīstītām, neapstrādātām garšām.
Dažkārt var palīdzēt sēnes novārīt ūdenī pirms ievietošanas marinādē. Tas ir tāpēc, ka sēnes labāk uzsūks marinādes garšas, ja tās būs siltas. Dažu veidu sēnes, piemēram, baltās pogšēnes, var gūt lielu labumu no vārīšanas dažas minūtes pirms ievietošanas marinādē.
Vislabākā marināde sēnei, ko gatavojas izmantot kā piedevu, varētu būt vārīta. Šīs marinādes satur tādas sastāvdaļas kā etiķis, eļļa, ķiploki un garšvielas, piemēram, oregano. Ideja ir sēņu marinādi pagatavot pannā kopā ar sēnēm 20 līdz 30 minūtes. Tas var palīdzēt mīkstināt asas garšas, piemēram, etiķi, vienlaikus ātri mīkstinot sēnes. Pēc tam visu maisījumu pirms pasniegšanas vajadzētu atdzesēt vai ļaut sasilt līdz istabas temperatūrai.
Sēņu marinādei grilam parasti ir daudz spēcīgāka garša nekā citām. Izmantotās sēnes var būt arī garšīgākas, piemēram, Portobello sēnes. Grilējot, marinādēs var iekļaut steiku mērci, aso mērci un pat bārbekjū mērci. Liesma no grila palīdzēs apbrūnināt marinādi un mīkstinās sēni. Daudzi cilvēki uzskata, ka grilētas sēnes, kas pagatavotas ar marinādi, var būt piemērots pat vissmagākās grilētās gaļas piedeva.