Ir daudzas alternatīvas ārstēšanas metodes, ko persona var apsvērt autisma ārstēšanai. Piemēram, autisma bērnu vecāki bieži šim nolūkam izmēģina diētas izmaiņas, un daži kā ārstēšanu uzskata veidus, kā izvadīt toksīnus no organisma. Turklāt alternatīvās autisma terapijas var ietvert tās, kas ietver radošumu, tostarp vizuālo mākslu un mūziku. Tā kā alternatīvās terapijas ne vienmēr var darboties, kā cerēts, cilvēkiem var būt noderīgi pirms to ieviešanas runāt ar ārstu.
Autisma personas vecāks var izvēlēties neļaut bērnam ēst pārtikas produktus, kas parasti izraisa alerģijas simptomus, piemēram, piena produktus un kviešus, pat ja nav pierādījumu, ka bērnam ir alerģija pret tiem. Daži vecāki arī izņem no bērnu uztura raugu un olbaltumvielas, ko sauc par lipekli un kazeīnu, lai palīdzētu. Vitamīnu piedevas, piemēram, vitamīns B-6 un B-12, bieži tiek iekļauti arī alternatīvā autisma ārstēšanā. Parasti pirms dramatisku izmaiņu veikšanas bērna uzturā vecākiem tiek ieteikts konsultēties ar dietologu, jo nopietni ierobežojumi var izraisīt uztura trūkumus.
Daži cilvēki uzskata, ka autisma attīstība var būt saistīta ar toksisku metālu uzkrāšanos. Kā tādas, dažas alternatīvas autisma ārstēšanas metodes ietver mēģinājumus tos izņemt no skartās personas ķermeņa. Divi no metāliem, kas bieži ir saistīti ar autismu, ir dzīvsudrabs un svins, un vecāki var meklēt helātu terapiju saviem bērniem, cenšoties izņemt šos un citus aizdomīgos metālus. Helātu terapija ietver ķīmiskas vielas injicēšanu skartās personas ķermenī, cerot, ka tā pieķersies aizskarošajiem metāliem un palīdzēs tos izvadīt no ķermeņa. Pacients var saņemt injekcijas vairāku nedēļu laikā, cerot izārstēt autismu, taču terapija arī izvada pacientam nepieciešamās minerālvielas un var radīt veselības problēmas.
Alternatīvas autisma ārstēšanas metodes var ietvert arī terapijas, kuru pamatā ir mākslas un radošuma izmantošana. Piemēram, mākslas terapija, ja to nodrošina pieredzējis, licencēts terapeits, palīdz uzlabot autisma cilvēka komunikācijas prasmes un spēju izmantot savu iztēli. Tas var arī palīdzēt viņam labāk interpretēt citu cilvēku sejas izteiksmes, kas var palīdzēt saziņā. Turklāt mākslas terapija var palīdzēt autisma cilvēkiem pārvarēt grūtības, pieskaroties noteikta veida materiāliem, tostarp tiem, kas ir mitri.
Mūzikas terapija var arī palīdzēt autisma indivīdam attīstīt komunikācijas prasmes un pat iemācīties izteikties neverbālā veidā. Autisma persona var gūt labumu arī no mūzikas terapijas, kas ietver spēles, jo viņa līdzdalība mudina viņu mijiedarboties ar citiem. Turklāt daudzi eksperti apgalvo, ka mūzika var palīdzēt smadzeņu un sociālajai attīstībai un palīdzēt cilvēkam veidot un uzlabot vitāli svarīgas motoriskās prasmes. Uz radošumu balstītas alternatīvas autisma ārstēšanas metodes var arī palīdzēt autisma cilvēkam labāk tikt galā ar skaņām un izmaiņām savā vidē, kas citādi varētu izrādīties viņu satraucošas.