Dažādas cilvēka vidussmadzeņu zonas parasti ir atbildīgas par neapzinātām reakcijām uz ārējiem stimuliem. Šeit tiek apstrādāti neironu signāli, kas nāk no daudzām cilvēka maņām, tostarp redzes, dzirdes un taustes. Šeit tiek koordinēta motora vadība – daudzi muskuļi, kas nepieciešami jebkuras ķermeņa kustības radīšanai. Daļēji apzināti augsti sportisti var piedzīvot, tostarp paaugstinātu modrību un precīzu fizisko reakciju, ko nodrošina daudzas vidussmadzeņu daļas, kas darbojas efektīvā sinhronitātē.
Anatomiski un funkcionāli cilvēka smadzenes ir sadalītas priekšējās smadzenēs, aizmugurējās smadzenēs un vidējās smadzenēs. Pēdējā zona atrodas netālu no smadzeņu centra un lielākoties nav redzama, izņemot no apakšpuses. Medicīnā to sauc par mesencephalon. Parasti to uzskata par smadzeņu stumbra paplašināšanos un pagarinājumu, kas ir atbildīgs par svarīgākām autonomām funkcijām, piemēram, sirdsdarbību, elpošanu un augšanu. Pēc lēmuma gulēt, tas regulē tievo robežu starp atpūtu un uzbudinājumu, kas nepieciešams izdzīvošanai un izaugsmei.
Vidussmadzenes ir visattīstītākā smadzeņu zona. Lai gan cilvēkiem ir ļoti lielas priekšējās un pakaļējās smadzenes, visiem mugurkaulniekiem ar centrālo nervu sistēmu ir šī smadzeņu pamatstruktūra. Turklāt tā vispārējā arhitektūra, tā daļu organizācija ir vienāda pat pārakmeņojušos paleontoloģiskajos dzīvniekos.
Viena no redzamākajām daļām šajā mugurkaulnieku smadzeņu apgabalā ir tektums jeb corpora quadrigemina, kas nosaukts tās kvadrantu struktūras dēļ. Katru no četrām daivām sauc par colliculus. Galvenie redzes nerva kūļi no katras acs šķērso ceļu uz pretējām tektuma pusēm. Ir klīniski pierādīts, ka augšējās jeb augšējās kolikulas ir atbildīgas par sakādiskām acu kustībām, ātru un nelielu acu muskuļu vibrāciju, kas ļauj uztvert līnijas un formas. Apakšējais jeb zemākais kolikulu pāris saņem neironu signālus, ko izraisa gaismas enerģija, skaņas viļņi un gravitācija, ko reģistrē ausis un uztver attiecīgie trochleārie nervi.
Smadzeņu kātiņi, lieli nervu saišķi abās muguras smadzeņu pusēs, ir vēl viena nozīmīga smadzeņu zona. Tie nes ne tikai pamācošus eferentus nervus, piemēram, okulomotoro neironu, kas atbild par acu zīlīšu paplašināšanu un sašaurināšanos, bet arī aferentus nervus no citiem ķermeņa maņu orgāniem. Viens no svarīgākajiem nervu signāliem ir siltuma sajūta, ko lielākoties reģistrē temperatūras jutīgie ādas nervi. Vidējās smadzenes ir atbildīgas par šo kritisko vides datu apstrādi un koriģējošu pasākumu, piemēram, muskuļu drebuļu, izsniegšanu.
Liela daļa smadzeņu mēģinājumu koriģēt ķermeņa reakciju uz ārējiem stimuliem ir ķīmiska rakstura, nevis elektrisko signālu ieslēgšanas vai izslēgšanas slēdzis. Hipotalāms un citi smadzeņu dziedzeri izdala savas katalītiskās ķīmiskās vielas melnajā nigrā — melnajos audos smadzeņu kātiņu centrā. Viens no šiem hormoniem ir dopamīns, kas, kā zināms, ietekmē atkarības, kā arī tādas pašas civilizācijas cilvēka būtības kā pašmotivācija un sociālā pieradināšana.