Lielākā daļa negatīvo blakusparādību, kas saistītas ar pārāk daudz olbaltumvielu, sakņojas nieru asinsrites sistēmā. Lai gan ir tie, kas apstrīd šīs veselības komplikācijas, daudzi apgalvo, ka, pirmkārt, olbaltumvielu pārpalikums, ko organisms nevar absorbēt, palielina urīnvielas veidošanos urīnā, un tas var izraisīt dažādas blakusparādības visā organismā. ķermenis. Urīna veidošanās mehānisms organismā ir nieres, tāpēc palielināta darba slodze var palielināt nieru slimību risku un jau esošo nieru darbības traucējumu saasināšanos. Netiešāk šis process var palielināt podagras risku, kā rezultātā bieža urinēšana var izraisīt dehidratāciju. Turklāt kalcijs mēdz izdalīties ar urīnu kopā ar urīnvielas pārpalikumu, un daži pētnieki ir iebilduši, ka tas var palielināt osteoporozes un nierakmeņu risku.
Precīzāk, iemesls, kāpēc pārāk daudz olbaltumvielu izraisa augstāku urīnvielas koncentrāciju urīnā, ir tāpēc, ka liekā proteīna tiek novirzīts uz aknām, kur animo skābes tiks pārvērstas citās izmantojamās molekulās, izmantojot procesu, ko sauc par deanimāciju. Procesa laikā slāpeklis no animo skābēm aknās vispirms tiek pārveidots par amonjaku un pēc tam par urīnvielu. To izvadīšana ar urīnu ir nieru uzdevums, bet pārāk daudz olbaltumvielu uzturā rada lielu slodzi šiem orgāniem. Tiem, kuriem jau ir kāda veida nieru slimība, vislabāk ir uzturēt proteīnu uzņemšanu stabilā līmenī.
Podagra ir iekaisīga artrīta forma, ko raksturo urīnskābes uzkrāšanās locītavās. Daži apgalvo, ka pastāvīgs olbaltumvielu pārpalikums organismā palielina podagras risku. Nieres parasti palīdz izvadīt urīnskābi no organisma, taču nierēm uzliktā papildu slodze var traucēt šo funkciju.
Biežāka urinēšana ir iepriekšminētā bioloģiskā procesa acīmredzama blakusparādība. Katru reizi, kad indivīds urinē, lai izvadītu lieko urīnvielu, neizbēgami izdalīsies arī ūdens. Rezultātā pārāk daudz olbaltumvielu var ātri izraisīt dehidratāciju, par ko var liecināt tādi simptomi kā galvassāpes, muskuļu krampji vai reibonis.
Turklāt šī procesa laikā iegūtais urīnvielas pārpalikums parasti noved pie nestabila pH līmeņa. Pētnieki ir novērojuši paaugstinātu kalcija koncentrāciju urīnā tiem, kuru uzturā ir pārāk daudz olbaltumvielu, un daži uzskata, ka minētais kalcijs pastāv, lai līdzsvarotu pH līmeni. Lai gan pastāv daži strīdi, tas var radīt osteoporozes risku, jo organisms šim nolūkam var atkārtoti absorbēt kalciju no kauliem. Daži uzskata, ka kalcija uzņemšanas palielināšana var to kompensēt. Turklāt augstāka kalcija koncentrācija, kas cirkulē caur nierēm, var palielināt nierakmeņu veidošanās risku.