Mikrotoms ir ierīce, ko izmanto, lai sagrieztu ļoti plānas materiāla šķēles paraugos, ko sauc par sekcijām. Parasti to veic, sagatavojot priekšmetus mikroskopiskai izmeklēšanai. Mikrotomi ir pieejami vairākos dizainos, izmantojot dažādus griešanas komponentus. Tas ir paredzēts, lai pielāgotos sagatavojamā materiāla fizikālajām īpašībām un izmantojamā mikroskopa veidam. Bioloģisko sekciju mikroskopisko izpēti sauc par histoloģiju.
Ragavu mikrotomā sadalāmais materiāls tiek turēts bīdāmā atspolē, kas pārvietojas pa asmens virsmu. Lai sagatavotu materiālu griešanai, parafīna vaska vai epoksīda infūzija sacietē paraugu cietā vielā. Pēc tam paraugu ievieto mikrotoma atspolē. Atkarībā no parauga konsistences un nepieciešamā sekcijas biezuma tiek izmantoti vairāki dažādi asmeņu modeļi. Asmeņi var būt no metāla, stikla vai dimanta.
Griešanas asmens vai nazis rotācijas mikrotomā arī atrodas fiksētā stāvoklī attiecībā pret paraugu. Spararata rotācijas kustība tiek pārvērsta parauga horizontālā kustībā pa nazi. Parasti parauga nolaišana pozīcijā tiek veikta manuāli, izmantojot vadības riteni. Šī funkcija ir automatizēta jaunākajos rotācijas projektos, nodrošinot precīzāku griezumu.
Rotācijas mikrotomu dizains parasti tiek izmantots, ja ir nepieciešami kriogēnie apstākļi. Sadalīšana notiek šķidrā slāpekļa kamerā, ļaujot paraugam sacietēt stiklam līdzīgā stāvoklī. Rotācijas konstrukcija tiek izmantota arī ultramikrotomu paraugu ņemšanā, kur nepieciešamas īpaši plānas sekcijas. Ir vajadzīgas ļoti precīzas ražošanas pielaides, lai nodrošinātu precizitāti, kas nepieciešama, lai sagatavotu sekcijas elektronu mikroskopijai. Griešanas asmeņi parasti ir izgatavoti no dārgakmeņu kvalitātes dimantiem.
Atšķirībā no mehāniskajiem mikrotomiem, kas nonāk fiziskā saskarē ar paraugu, lāzera mikrotomiem parauga sagatavošana nav nepieciešama. Griešanas ierīce ir impulsa infrasarkanais lāzers. Tas ļauj ļoti precīzi kontrolēt paraugu ņemšanu un ir vienlīdz piemērojams gan mīkstajiem audiem, gan cietajiem materiāliem, piemēram, kauliem. Fiziskā kontakta ar parauga materiālu novēršana novērš lielu daļu piesārņojuma iespējas.
Mazāk stingriem lietojumiem students vai hobijs var izmantot rokas mikrotomu. Šīs ierīces ļauj ņemt audu sekcijas priekšmetstikliņu sagatavošanai, lai gan ar daudz mazāku precizitāti nekā laboratorijas instrumenti. Ierīce stingri notur parauga materiālu un ar precīziem soļiem virza griešanas pozīcijā. Pēc tam sadaļa tiek uzņemta manuāli ar skuvekļa nazi.