Kartupeļi jāuzglabā uzmanīgi, lai tie nebojātos. Parasti tie jāuzglabā vēsā, tumšā vietā. Uzglabājot kartupeļus, arī jāraugās, lai ap tiem varētu brīvi cirkulēt gaiss un tie ir sausi. Sagrieztus vai nomizotus kartupeļus īsu brīdi var uzglabāt aukstā ūdenī, bet pagatavotos kartupeļu ēdienus var sasaldēt.
Nepareizi uzglabāti kartupeļi var uzdīgt, kļūt zaļi vai kļūt mīksti un saburzīti. Parasti kartupeļus istabas temperatūrā var uzglabāt apmēram nedēļu. Pēc šī laika tie bieži sāks kļūt slikti. Uzglabātie kartupeļi ir regulāri jāpārbauda, un tie, kas sākuši kļūt mīksti, veidojušies pelējums vai mīkstas vietas, ir jānoņem.
Vēsa vieta ir vislabākā, ja kartupeļus uzglabā ilgāk par nedēļu. Silts gaiss, kura temperatūra pārsniedz 50 °C, var izraisīt dīgšanu. Sakņu pagrabs parasti ir ideāla vieta kartupeļu uzglabāšanai, taču derēs arī vēss pagrabs vai garāža. Daži cilvēki pat dod priekšroku to uzglabāšanai ledusskapī, taču tas var nedaudz mainīt kartupeļu garšu un krāsu.
Arī vietai, kur cilvēks glabā kartupeļus, jābūt tumšai. Kad kartupeļi tiek pakļauti gaismai, īpaši saules gaismai, tie sāk ražot hlorofilu. Tā rezultātā uz kartupeļiem var parādīties spilgti zaļi plankumi. Hlorofils var padarīt kartupeļus rūgtu garšu, un tas var būt arī toksisks ļoti lielos daudzumos.
Uzglabājot kartupeļus, var izmantot necaurspīdīgus traukus, ja nav pieejama tumša vieta. Tomēr šīm tvertnēm jābūt pareizi vēdinātām, lai nodrošinātu gaisa cirkulāciju ap tiem. Kartupeļu traukiem nevajadzētu būt hermētiski noslēgtam, jo tas var aizturēt mitrumu. Šī notvertā mitruma dēļ kartupeļi var kļūt mīksti un saburzīti, un tas var veicināt pelējuma augšanu. Arī kartupeļus pēc mazgāšanas nekad nevajadzētu uzglabāt, jo tie var būt mitri. Personām pirms kartupeļu mazgāšanas vajadzētu pagaidīt, līdz kartupeļi ir gatavi vārīšanai.
Sagriezti vai mizoti kartupeļi bieži ātri kļūst brūni, ja tie netiek drīz pagatavoti. Lai kartupeļu mīkstums nekļūtu brūns, sagrieztus kartupeļus var uzglabāt traukā ar aukstu ūdeni. Ūdenim var pievienot ledu, lai tas būtu auksts, vai arī trauku var uzglabāt ledusskapī. Auksts ūdens parasti saglabā kartupeļu mīkstumu baltu vairākas stundas.
Parasti nav ieteicams sasaldēt kartupeļus, kas nav vārīti. Tomēr vārīti vai blanšēti kartupeļi parasti ļoti labi sasalst. Kartupeļu ēdienus, piemēram, kartupeļu biezeni vai ceptos kartupeļus, var pagatavot pirms laika un uzglabāt saldētavā.