Jūras arheoloģija, kas pazīstama arī kā jūras arheoloģija, ir zemūdens artefaktu un ainavu izpēte. Bieži vien tas nozīmē kuģu vraku izpēti, lai gan ir atklātas arī citas interesantas zemūdeņu arheoloģiskas iezīmes, piemēram, aizvēsturisku kempingu paliekas Ziemeļjūrā vai gruveši, kas palikuši zemestrīces laikā, sašķidrinot zemi zem ostas pilsētas, piemēram, Port Royal Antiļas. Parasti zemūdens artefakti ātri bojājas, bet dažos gadījumos, tikai viens no vairākiem simtiem, saglabāšanās ir ievērojama, un artefakti, kas būtu sabojājušies vai jau sen būtu izlaupīti, ja tie būtu uz sauszemes, joprojām ir saglabājušies. Viens slavens piemērs ir Tjūdoru laikmeta karakuģa Mary Rose vraks, kas nogrima kaujā ar frančiem 1545. gadā.
Dažas no aizraujošākajām senās pasaules arheoloģiskajām liecībām nāk no ļoti veciem kuģu vrakiem ar saglabātiem materiāliem. Vecākie kuģu vraki, kas pētīti jūras arheoloģijas jomā, ir no bronzas laikmeta, un daži kuģi un kanoe laivas ir datēti ar 1400. gadu pirms mūsu ēras vai agrāk. Viens no slavenākajiem ir Uluburunas kuģa vraks, labi saglabājies kuģa vraks pie Turcijas dienvidu krastiem ar plašu kravu. Kravā bija ziloņkauls, nīlzirgu ziloņkauls, vara lietņi, skārda lietņi, neapstrādāts stikls, Ēģiptes melnkoks, zelts, strausu olas, terebinta sveķi, ziloņkaula trauki, zelta kauss, dažādas krūzes, lampas un vāzes, itāļu zobens, Eiropas šķēpi. , akmens ceremonijas cirvis un daudz ko citu. Tik lieli neskartu materiālu atradumi virszemes arheoloģijā ir ļoti reti, viens no primārajiem un vienīgajiem piemēriem ir faraonu kapu atklāšana.
Nākamā lielākā iespaidīgo kuģu vraku klase jūras arheoloģijā ir Grieķijas un Romas vēlā bronzas laikmeta un agrīnā dzelzs laikmeta. Romas imperatora Kaligulas milzīgās izklaides liellaivas ir atklātas Nemi ezerā, Itālijā, kur saldūdens ļauj labāk saglabāt koksni un artefaktus. Viena no šīm (fragmentārajām) liellaivām bija 104 m (341 pēdu) gara, trešais lielākais jebkad uzbūvētais koka kuģis, un lielāks kuģis tika uzbūvēts tikai aptuveni 1,800 gadus vēlāk. To sauca par Kaligulas milzu kuģi, tas bija sešus klājus augsts un tajā varēja uzņemt vairāk nekā 1,000 cilvēku. Kaligulas milzu kuģis ir kļuvis par Kaligulas un citu Romas imperatoru, piemēram, Nerona, hedonismu un savtīgumu.
Viena bieža, ļoti spekulatīva jūras arheoloģijas asociācija sabiedrībā ir saistīta ar iespējamo Atlantīdas atklāšanu. Lai gan Atlantīda nepārprotami bija literāra ierīce, ko Platons izgudroja, lai aprakstītu savu ideālo sabiedrību, tūkstošiem gadu daudzi cilvēki ir maldināti, domājot, ka tā patiešām pastāv, un tas ir izraisījis plašus zemūdens izmeklējumus. Dažas no šīm izmeklēšanām patiesībā ir atklājušas dažus interesantus artefaktus, taču katrā gadījumā tie ir bijuši saistīti ar zināmām senās pasaules kultūrām, kas nekad nav bijusi pilnīgi jauna un neatklāta kultūra.