Organiskais kanēlis ir kanēlis, ko audzē, neizmantojot kaitīgus pesticīdus vai aizliegtus sintētiskos mēslošanas līdzekļus. Saskaņā ar Amerikas Savienoto Valstu Lauksaimniecības departamenta (USDA) datiem, lai kanēli uzskatītu par bioloģisku, to nevar novākt no bioinženierijas augiem vai pakļaut jonizējošam starojumam. Turklāt kanēlis ir jāaudzē, izmantojot lauksaimniecības metodes, kurām ir vismazākā ietekme uz vidi, un tas ir jānovāc, izmantojot godīgas tirdzniecības praksi.
Bioloģiskā kanēļa audzēšanas process sākas no sēklām. Kanēlis tiek novākts no vairāku šķirņu kanēļa koku mizas. Lai koki, no kuriem ievākts kanēlis, tiktu uzskatīti par bioloģiskiem, nedrīkst būt audzēti no ģenētiski modificētām sēklām. Pēc tam kanēļa koku audzē, ievērojot īpašus mēslojuma un pesticīdu kritērijus.
Kad kanēļa koks aug, lielāko daļu sintētisko mēslojumu ir aizliegts izmantot bioloģiskajām kultūrām. Notekūdeņu dūņas dažkārt izmanto nebioloģiskām kultūrām, taču tās neizmanto, ja kanēļa ražu uzskata par bioloģisku. Barības vielas bioloģisko kultūru augsnē tiek uzturētas, izmantojot tādas lauksaimniecības metodes kā augseka un augsnes apstrāde. Kompostēti kūtsmēsli ir apstiprināts mēslojums bioloģiskajām kultūrām. Trīs gadus pirms ražas novākšanas aizliegto mēslojumu neizmanto bioloģiskajām kultūrām.
Bioloģiskās kanēļa kultūru kaitēkļu apkarošanai izmanto bioloģiskas metodes. Var izdalīties labvēlīgi kukaiņi, kas vai nu barojas ar kokiem kaitīgiem kukaiņiem, vai traucē kukaiņu savairošanos un vairošanos. Kaitīgos kukaiņus var noņemt arī ar rokām vai ar specializētas tehnikas palīdzību. Ierobežots skaits pesticīdu ir apstiprināts lietošanai bioloģiskajās kultūrās, ja kaitīgos kaitēkļus nevar kontrolēt ar citiem līdzekļiem. Aizliegtos pesticīdus trīs gadus pirms ražas novākšanas neapstrādā kanēļa kultūrām.
Kanēlis tiek novākts no koka iekšējās mizas. Plāno iekšējo mizu noņem un žāvē ruļļos vai spalvās. Pēc tam kanēli pārdod nūjiņu veidā vai samaļ pulverī. Apstarošanu, ko dažkārt izmanto ātrbojīgām pārtikas kultūrām, lai pagarinātu to kalpošanas laiku tirgū, neizmanto organiskajam kanēlim.
Dabīgais kanēlis nav tas pats, kas organiskais kanēlis. Termins dabīgs nozīmē, ka kanēlim nav pievienotas mākslīgas sastāvdaļas, krāsvielas vai konservanti. Dabīgais kanēlis var saturēt pesticīdus vai mākslīgā mēslojuma atliekas. Organiskais kanēlis, lai gan tas ir audzēts, neizmantojot kaitīgus pesticīdus vai mēslojumu, tomēr var saturēt nelielu daudzumu šo ķīmisko vielu. Daži pesticīdi un mēslošanas līdzekļi var palikt augsnē gadu desmitiem, galu galā uzsūcot kanēļa kokos.