Mikroviļņu popkorna ieviešana 1980. gados šķita kā dabisks progress pēc panākumiem, kas gūti uz plīts virsmas un popkorna ar gaisu. Patērētājs mikroviļņu krāsnī uz dažām minūtēm ievieto salocītu maisiņu ar eļļu, aromatizētāju un popkorna kodoliem. Rezultāti var būt dažādi, sākot no puspaplātināta maisiņa līdz kūpināšanas maisam ar oglekli, taču kopumā mikroviļņu popkorns bija līdzīgs citiem popkorna veidiem un tika pagatavots daudz īsākā laikā.
Jautājumi par mikroviļņu popkorna drošību sāka rasties, kad vairāki popkorna rūpnīcas darbinieki ziņoja par smagām elpošanas problēmām, strādājot ar popkorna apstrādei izmantotajām ķīmiskajām vielām. Konkrēti, ķīmiska viela, kas pazīstama kā diacetils, bija aizdomas par kairinātāju. Diacetilu izmanto, lai radītu sviesta aromātu dažādās garšvielās un pārstrādātos pārtikas produktos, tostarp mākslīgā sviesta aromātā, ko izmanto mikroviļņu popkornam. Nelielus diacetila daudzumus neuzskata par toksiskiem, taču, karsējot rūpnīcas mērogā, izgarojumi var izraisīt elpošanas traucējumus, kas pazīstami kā popkorna plaušas.
Kad publiski kļuva zināms par popkorna strādnieku iedarbību uz diacetilu, daudzi veselības aprūpes speciālisti kļuva nobažījušies par mikroviļņu popkorna drošību patērētāju līmenī. FDA un citas aģentūras noteica, ka diacetila daudzums vidējā maisiņā nesasniedza toksisku līmeni, lai gan kritiķi apšaubīja šo atklājumu pamatotību pēc tam, kad atklāja, ka patērētāju līmenī faktiski nav veiktas pārbaudes. Gandrīz visi ziņotie popkorna plaušu gadījumi radās popkorna rūpnīcas darbiniekiem, taču viens patērētājs, kurš katru dienu ēda divus popkorna maisiņus un parasti sajuta izgarojumus, saslima ar vieglāku slimības formu.
Ja ar mikroviļņu popkornu ir saistītas jebkādas briesmas, tas ir visvairāk klāt, kad maiss tiek pirmo reizi atvērts un izplūst sakarsēti tvaiki. Ieelpojot šos izgarojumus, patērētājs tiks pakļauts augstākajam diacetila līmenim, kāds tas ir iespējams patērētāja līmenī. Tas var izraisīt mazāko gaisa kanālu bojājumus patērētāja plaušās vai izraisīt jau esošu astmas lēkmi. Maziem bērniem un tiem, kam ir traucēta plaušu kapacitāte, var būt arī nevēlama reakcija pēc pirmo karstā mikroviļņu popkorna maisiņa izgarojumu ieelpošanas.
Citas sastāvdaļas, kas atrodas mikroviļņu popkornā, netiek uzskatītas par toksiskām, lai gan daži veselības eksperti brīdina nelietot lielu daudzumu nātrija vai daļēji hidrogenētu eļļu. Tajā parasti tiek izmantotas veselīgākas eļļas, kādas noteiktas filmas stila popkorns tiek pasniegts teātros vai koncesijas stendos. Izvairīšanās no mākslīgā sviesta vai papildu sāls pievienošanas vienmēr ir laba ideja veselīgākai uzkodai.