Zema ogļhidrātu satura diētas blakusparādības galvenokārt ir saistītas ar vielmaiņu un tiešu fizisko reakciju uz patērētās pārtikas veidiem. Pārmērīga gāze un aizcietējums ir divas no visbiežāk sastopamajām problēmām, kas saistītas ar šāda veida diētu. Bieži vien diēta ar zemu ogļhidrātu daudzumu uzņem pārtikas enerģiju no proteīna palielināšanās, kas organismā var būt arī pārpalikums. Šāda veida diētu bieži dēvē par ketogēnu, jo nepietiekams ogļhidrātu daudzums var izraisīt ketozi, stāvokli, kurā indivīds zaudē neveselīgu ūdens un nātrija daudzumu.
Citas bieži sastopamas zema ogļhidrātu diētas blakusparādības ir neraksturīgs muskuļu vājums vai krampji un galvassāpes. Daži pacienti ziņo arī par sliktu elpu un neizskaidrojamiem izsitumiem. Šos simptomus var izsekot ogļhidrātu un cukura trūkumam, kas organismam ir nepieciešami, lai radītu enerģiju un pareizi apstrādātu pārtiku.
Ketogēna diēta ir režīms, kurā ogļhidrātu patēriņš nav pietiekams, lai uzturētu labu veselību. Tas noved pie ketozes, stāvokļa, kad ketonvielu pārpalikums kavē organisma spēju apstrādāt glikozi, kas ir galvenais enerģijas avots. Ketonu ķermeņi attīstās taukskābju sadalīšanās rezultātā enerģijas iegūšanai. Ja ir pārāk daudz ketonu, tiek traucēta tauku vielmaiņa un organisms sāk izvadīt lieko sāli un ūdeni. Tas bieži vien var izraisīt šo elementu trūkumu.
Muskuļi un aknas uzglabā enerģiju, ko nodrošina ogļhidrāti. Tā kā šie krājumi var ilgt diezgan ilgu laiku, zema ogļhidrātu satura diētas blakusparādību attīstība var aizņemt kādu laiku. Tomēr ir iespējams, ka ķermenis sāk darboties nepareizi zema ogļhidrātu satura diētas sākumposmā atkarībā no indivīda veselības un diētas ekstremitāšu.
Ir vairākas svara zaudēšanas diētas, kuru pamatā ir zema ogļhidrātu satura režīms. Daudzas no šīm diētām ir vērstas uz maltītēm ar augstu olbaltumvielu saturu un daudz dārzeņu. Viens no slavenākajiem no tiem ir Atkinsa diēta, kas bija savas popularitātes virsotnē deviņdesmitajos gados. Kopš tā laika daudzi ārsti to ir diskreditējuši tāpēc, ka, lai gan diēta palīdz zaudēt svaru, tā veicinātā daudz olbaltumvielu un trekna pārtika mēdz apdraudēt diētas ievērotāja vispārējo veselību.
Neraugoties uz daudzajām iespējamām negatīvajām blakusparādībām, ko rada diēta ar zemu ogļhidrātu saturu, ir vairāki nosacījumi, kuru gadījumā šāda shēma ir paredzēta. To parasti lieto diabēta, epilepsijas un aptaukošanās ārstēšanai. Daži ārsti to var ieteikt arī pacientiem ar policistisko olnīcu sindromu vai hroniska noguruma sindromu.