Kaperaugu mazos, apaļos slēgtos augu pumpurus var izmantot daudz un dažādos veidos ēdiena gatavošanā. Tā kā augi savvaļā aug Vidusjūras valstīs, daudziem šo reģionu ēdieniem ir nepieciešami kaperi. Ar asas garšas kaperiem var aizstāt jebkura veida olīvas. Kaperus var izmantot salātos, mērcēs vai kā kūpinātu zivju šķīvja garnējumu. Viens no populārākajiem klasiskajiem itāļu kaperu ēdieniem ir vistas piccata.
Lai pagatavotu vistas piccata, plānus mājputnu gaļas gabalus bez kauliem vispirms apviļ ar miltiem, pirms tie tiek cepti olīveļļā. Pēc tam pagatavoto vistu izņem no pannas un maisot karsē vīnu, zaļumus, ķiploku un citrona šķēles, lai izveidotu mērci. Kaperus pievieno gatavošanas laika beigās. Jebkurā vārītajā kaperu ēdienā kaperi jāpievieno pašā galā, lai tie nekļūtu pārāk biezi.
Dažiem pavāriem patīk cept kaperus pirms pievienošanas ēdieniem, lai tie kļūtu īpaši kraukšķīgi. Ir pieejami arī dažāda veida kaperu produkti, kas ietekmē ēdiena tekstūru un garšu. Ir sāli fasēti, kā arī marinēti kaperu produkti. Daudzi pavāri izvēlas vienu veidu, nevis otru, taču abus veidus var izmantot visu veidu karsto un auksto ēdienu receptēs.
Kaperus var izmantot, lai izveidotu izsmalcinātus kartupeļu, olu vai tunča salātu variantus. Garšīgo augu pumpuru var pievienot gatavajam tuncim, olai vai kartupeļiem kopā ar majonēzi, olīvām, sarkanajiem sīpoliem, vinegreta mērci un svaigi maltiem pipariem. Francijā kaperus bieži izmanto majonēzes mērcē, lai pasniegtu kopā ar jūras veltēm. Aukstām vasaras vakariņām kaperus var pievienot zivju un rīsu salātiem; to var pasniegt uz zaļumu gultas, piemēram, salātu, spinātu un smalki rīvētu kāpostu maisījuma.
Vīna, citronu, garšaugu un kaperu baltās mērces var pasniegt karstas virs vārītām jūras veltēm, piemēram, ķemmīšgliemenes. Izmantotie augi var ietvert dilles vai estragonu. Sinepju un kaperu mērce var papildināt vārītas vistas krūtiņas. Dažādu veidu makaronu mērču garšu var uzlabot, pievienojot kaperus. Lai gan kaperi gandrīz vienmēr tiek izmantoti veseli ēdiena gatavošanā to mazā izmēra dēļ, tos vispirms sagriežot šķēlēs, ir tendence pastiprināt to garšu.
Tā kā lielākajā daļā kaperu produktu ir daudz sāls, tos nevajadzētu lietot, gatavojot ēdienu tiem, kuri ievēro diētu ar zemu nātrija saturu. Tiek uzskatīts, ka kaperi ir labs antioksidanta rutīna avots. Tiek uzskatīts, ka antioksidanti palīdz atbrīvot ķermeni no stresa un brīvajiem radikāļiem, kas var izraisīt slimības.